原发性Burkitt淋巴瘤肿瘤与正常CD19+ B细胞miRNA靶标组微阵列分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE107325

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

微小RNA（miRNA）是一类参与基因表达转录后调控的小型非编码RNA。与正常B细胞相比，伯基特淋巴瘤（BL）中已报道存在miRNA水平失调，并且已在BL细胞系中鉴定出若干miRNA靶基因。本研究首次比较了原发性BL肿瘤与正常B细胞的miRNA靶标组。对两份冷冻诊断性BL组织样本和三份从常规切除的扁桃体中分离的CD19+ B细胞样本进行AGO2-RNA免疫沉淀（AGO2-RIP），揭示了BL与正常B细胞具有不同的miRNA靶标组。在BL中，miR-17~92簇的靶标被AGO2-IP富集的频率显著更高，而miR-29和miR-150的靶标在正常B细胞中被AGO2-IP富集的频率更高。此外，我们发现BL中的miRNA靶基因主要参与细胞周期和细胞死亡。对BL肿瘤样本和扁桃体组织进行免疫组织化学染色，证实了六个所选miRNA靶标中有两个的蛋白水平发生改变，这与BL和正常B细胞之间AGO2-IP富集的差异一致。

将原发BL病例中AGO2-IP富集基因与BL细胞系进行比较表明，使用BL细胞系的研究可能遗漏约一半的miRNA靶标，而在细胞系中鉴定出的miRNA靶基因中近60%在原发BL病例中并未显示AGO2-IP富集。我们的结果证明了在原发肿瘤中研究miRNA-靶标相互作用的必要性和可行性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。