滤泡性淋巴瘤基因表达谱数据集
该数据集来自omicsdi.org,收录滤泡性淋巴瘤(FL)的基因表达谱数据。FL是惰性但不可治愈的非霍奇金淋巴瘤亚型,至少90%患者携带t(14;18)易位,部分患者存在活化性EZH2突变

基本信息
资源简介
滤泡性淋巴瘤基因表达谱数据集
该数据集来自omicsdi.org,收录滤泡性淋巴瘤(FL)的基因表达谱数据。FL是惰性但不可治愈的非霍奇金淋巴瘤亚型,至少90%患者携带t(14;18)易位,部分患者存在活化性EZH2突变。研究对新鲜冷冻FL标本提取总RNA,与Affymetrix HG-U133 plus 2芯片杂交,比较EZH2突变与未突变亚组的差异基因表达,并采用高B细胞含量病例增强肿瘤细胞信号识别。数据可用于FL分子分型及差异表达分析(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):滤泡性淋巴瘤(FL)是一种惰性但不可治愈的非霍奇金淋巴瘤亚型。这些肿瘤在至少90%的患者中携带t(14;18)易位。近年来,在相当数量的FL患者中发现了活化性EZH2突变。进行基因表达谱分析(GEP)以确定FL中EZH2突变亚组与未突变亚组之间的差异基因表达。从诊断为FL的新鲜冷冻标本中提取的总RNA经处理后与Affymetrix HG-U133 plus 2芯片杂交。为增强仅针对FL肿瘤细胞中差异基因表达的识别,具有高B细胞含量的FL病例(富集B细胞特征>2-fol
【主题与分类】
主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-55267
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
滤泡性淋巴瘤(FL)是一种惰性但不可治愈的非霍奇金淋巴瘤亚型。这些肿瘤在至少90%的患者中携带t(14;18)易位。近年来,在相当数量的FL患者中发现了激活性EZH2突变。为确定FL中EZH2突变亚组与未突变亚组之间的差异基因表达,进行了基因表达谱分析(GEP)。从新诊断FL的冷冻新鲜标本中提取总RNA,并与Affymetrix HG-U133 plus 2芯片杂交。为增强仅对FL肿瘤细胞中差异基因表达的识别,选择B细胞含量高的FL病例(B细胞特征评分高于整个FL数据集中B细胞特征(泛B细胞标志物)均值2倍以上)进行分析。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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