十二指肠滤泡性淋巴瘤基因表达谱
该数据集为十二指肠滤泡性淋巴瘤(DFL)的基因表达谱,来源于ebi.ac.uk,共包含55个样本,涵盖DFL、结内滤泡性淋巴瘤、胃MALT淋巴瘤、正常十二指肠黏膜、结内反应性淋巴组织增生及正常胃黏膜等多类组织

基本信息
资源简介
十二指肠滤泡性淋巴瘤基因表达谱
该数据集为十二指肠滤泡性淋巴瘤(DFL)的基因表达谱,来源于ebi.ac.uk,共包含55个样本,涵盖DFL、结内滤泡性淋巴瘤、胃MALT淋巴瘤、正常十二指肠黏膜、结内反应性淋巴组织增生及正常胃黏膜等多类组织。数据集属于肿瘤/淋巴瘤分类,主题标签为transcription profiling by array,物种为Homo sapiens。其研究目的在于利用基因表达谱(GEP)阐明DFL的分子发病机制,并揭示DFL兼具结内滤泡性淋巴瘤(NFL)与MALT淋巴瘤特征的特点。该数据集适合用于比较不同淋巴瘤类型与正常黏膜组织之间的转录组差异,为理解DFL的分子病理提供表达谱层面的数据基础。
【数据集背景】
十二指肠滤泡性淋巴瘤(DFL)是一种发生在十二指肠的淋巴瘤类型。源站描述指出,该数据集的核心目的是利用基因表达谱(GEP)阐明DFL的分子发病机制。研究背景中的一个关键认识是:DFL同时具有NFL和MALT淋巴瘤的特征。这一特点意味着,要理解DFL的分子病理,需要将其表达谱与结内滤泡性淋巴瘤、胃MALT淋巴瘤以及正常黏膜组织等多种参照样本进行比较。该数据集正是在这一研究目标下构建的转录组表达谱资源,主题标签为transcription profiling by array,研究对象为Homo sapiens。
【数据内容】
该数据集共检查了55个样本,具体构成如下:10例DFL、18例NFL、10例胃MALT淋巴瘤、5例正常十二指肠黏膜、8例结内反应性淋巴组织增生以及4例正常胃黏膜。样本类型覆盖了目标疾病组织、相关淋巴瘤类型、反应性增生组织以及正常十二指肠和胃黏膜对照,构成了一个多组别比较的表达谱集合。数据集的主题标签为transcription profiling by array,物种为Homo sapiens。除上述样本构成与标签信息外,源站未提供关于具体基因数量、表达矩阵格式、平台芯片型号或数据文件组织的进一步说明。
【采集与来源】
该数据集来源于ebi.ac.uk。源站描述说明了样本的疾病与组织类型构成及样本数量,但未提供样本采集地点、采集时间、患者人群特征、伦理审批信息或具体实验操作流程。上述内容源站未提供。
【适用场景】
基于其样本构成,该数据集适用于以下表达谱层面的研究场景:比较DFL与NFL、胃MALT淋巴瘤之间的转录组差异,以探讨DFL兼具两类淋巴瘤特征的分子基础;将DFL与正常十二指肠黏膜、正常胃黏膜进行对照分析,识别疾病相关的表达变化;利用结内反应性淋巴组织增生作为参照,区分肿瘤性与反应性淋巴组织的表达特征。该数据集面向转录组表达谱分析,主题标签为transcription profiling by array,物种为Homo sapiens。关于具体的分析流程、统计方法或验证实验,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用说明,包括数据下载方式、文件格式、预处理步骤、归一化方法或分析工具建议。使用者需依据来源站ebi.ac.uk的通用数据访问规则自行获取与处理。
【质量与限制】
该数据集的样本量为55例,各组样本数分别为10、18、10、5、8和4例,其中正常胃黏膜组仅4例,样本量相对有限。源站未提供关于数据质量评估、批次效应、技术重复或缺失值处理的信息。此外,源站描述仅涉及研究目的与样本构成,未给出任何分析结论或验证结果,因此该数据集不宜被直接引用为关于DFL分子机制的既定结论。其他质量相关细节源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、许可条款或使用限制信息。使用前应查阅来源站ebi.ac.uk上的相应记录以确认引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-48047
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Katsuyoshi Takata; Motohiko Tanino; Daisuke Ennishi; Akira Tari; Yasuharu Sato; Hiroyuki Okada; Yoshinobu Maeda; Naoe Goto; Hiroshi Araki; Mai Harada; Midori Ando; Masaya Iwamuro; Mitsune Tanimoto; Kazuhide Yamamoto; Randy Gascoyne; Tadashi Yoshino (2014). Gene expression profile of duodenal follicular lymphoma [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-48047
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