滤泡性淋巴瘤细胞系RL的H3K4me3、H3K37me3和Suz12 ChIP-chip数据
源站描述显示,研究对RL细胞进行全基因组亚硫酸氢盐测序分析,发现大量甲基化基因是ES细胞中的polycomb靶基因,进而通过ChIP-chip确定被polycomb蛋白Suz12结合的甲基化基因,并比较RL细胞中DNA甲基化与组蛋白修饰

基本信息
资源简介
滤泡性淋巴瘤细胞系RL的H3K4me3、H3K37me3和Suz12 ChIP-chip数据
ChIP-chip from the follicular lymphoma cell line RL with H3K4me3, H3K37me3 and Suz12
该数据集来自ebi.ac.uk,为滤泡性淋巴瘤细胞系RL的ChIP-chip实验数据,检测H3K4me3、H3K37me3和Suz12,采用tiling array平台,物种为Homo sapiens。源站描述显示,研究对RL细胞进行全基因组亚硫酸氢盐测序分析,发现大量甲基化基因是ES细胞中的polycomb靶基因,进而通过ChIP-chip确定被polycomb蛋白Suz12结合的甲基化基因,并比较RL细胞中DNA甲基化与组蛋白修饰。数据可用于研究滤泡性淋巴瘤中DNA甲基化与组蛋白修饰的关系(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们对滤泡性淋巴瘤细胞系RL进行了全基因组亚硫酸氢盐测序分析,发现大量甲基化基因是ES细胞中的polycomb靶基因。因此,我们进行了ChIP-chip实验,以确定被polycomb蛋白Suz12结合的甲基化基因。尽管28%的MRI是ES细胞中的PRC2靶基因,我们的ChIP-on-Chip分析显示,在RL细胞体内,只有13%的MRI与H3K27Me3标记相关,只有5%的MRI被Suz12结合。比较RL细胞中DNA甲基化与组蛋白修饰。
【主题与分类】
主题标签:ChIP-chip by tiling array、Homo sapiens。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-20019
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- OpenDataLab:
数据说明
Huidong Shi (2010). ChIP-chip from the follicular lymphoma cell line RL with H3K4me3, H3K37me3 and Suz12 [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-20019
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