乳房植入物相关间变性大细胞淋巴瘤浅层全基因组测序拷贝数分析及全外显子组测序数据
该数据集来自omicsdi.org,包含乳房植入物相关间变性大细胞淋巴瘤(BIA-ALCL)的浅层全基因组测序数据,覆盖29例BIA-ALCL患者用于拷贝数分析,并以24例ALK阴性ALCL样本作为对照队列;另含7例BIA-ALCL样本的全外显子组测序数据

基本信息
资源简介
乳房植入物相关间变性大细胞淋巴瘤浅层全基因组测序拷贝数分析及全外显子组测序数据
该数据集来自omicsdi.org,聚焦于乳房植入物相关间变性大细胞淋巴瘤(BIA-ALCL)的基因组变异研究,主题标签为Genomics,本站归类为肿瘤/淋巴瘤。数据集由两部分测序内容构成:一是针对29例BIA-ALCL患者的浅层全基因组测序,用于拷贝数分析,并纳入24例ALK阴性ALCL样本作为对照队列;二是7例BIA-ALCL样本的全外显子组测序数据。整体设计以拷贝数变异分析为主线,辅以对照队列比较和外显子层面的序列信息,为研究BIA-ALCL的基因组特征提供了测序数据基础。
【数据集背景】
乳房植入物相关间变性大细胞淋巴瘤是一种与乳房植入物相关的间变性大细胞淋巴瘤。该数据集围绕这一疾病类型组织测序数据,所属分类为肿瘤/淋巴瘤,主题标签为Genomics,说明其关注点在于从基因组层面刻画该疾病的特征。数据集中同时设置ALK阴性ALCL对照队列,有助于在比较视角下考察BIA-ALCL的拷贝数变化特点。
【数据内容】
数据集包含两类测序数据。第一类为浅层全基因组测序数据,覆盖29例BIA-ALCL患者,用于拷贝数分析;同一部分还包含24例ALK阴性ALCL样本,作为对照队列。第二类为全外显子组测序数据,涉及7例BIA-ALCL样本。数据内容以拷贝数分析为核心,辅以外显子组测序信息,样本构成包括BIA-ALCL患者样本与ALK阴性ALCL对照样本。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org。源站描述表明,其浅层全基因组测序针对29例BIA-ALCL患者开展,用于拷贝数分析,并以24例ALK阴性ALCL样本作为对照队列;同时包含7例BIA-ALCL样本的全外显子组测序数据。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批及具体测序平台等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于BIA-ALCL的拷贝数变异分析,可支持在29例患者与24例ALK阴性ALCL对照之间开展比较性研究;全外显子组测序部分可用于7例BIA-ALCL样本的外显子层面序列考察。整体上适合肿瘤/淋巴瘤基因组学方向的研究使用,主题标签为Genomics。
【使用方法】
使用时可依据数据组织方式区分浅层全基因组测序与全外显子组测序两类内容:前者面向拷贝数分析,包含BIA-ALCL患者与ALK阴性ALCL对照两组样本;后者面向7例BIA-ALCL样本的外显子组序列分析。关于具体的文件格式、数据处理流程、分析工具与参数设置,源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息、测序深度、覆盖度、样本纳入排除标准及数据完整性说明。数据集样本量有限,浅层全基因组测序覆盖29例BIA-ALCL患者与24例ALK阴性ALCL对照,全外显子组测序仅涉及7例BIA-ALCL样本;使用时应结合具体研究目的考虑样本规模与数据类型的适用范围。其他质量相关细节源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
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无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001003962
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Breast implant-associated anaplastic large cell lymphoma (BIA-ALCL) shallow whole genome sequencing of 29 BIA-ALCL patients for copy number analysis and 24 Alk-negative ALCL samples as control cohort. 7 Whole exome sequencing BIA-ALCL samples.
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