非肿瘤人肺组织全基因组基因表达谱:Laval 数据集
该数据集收录非肿瘤人肺组织的全基因组基因表达谱,样本来自接受肺癌手术患者的肺标本,取自无肿瘤的外周组织,手术时间为2004年4月至2008年12月,标本冻存于FRSQ呼吸健康网络生物样本库

基本信息
资源简介
非肿瘤人肺组织全基因组基因表达谱:Laval 数据集
该数据集收录非肿瘤人肺组织的全基因组基因表达谱,样本来自接受肺癌手术患者的肺标本,取自无肿瘤的外周组织,手术时间为2004年4月至2008年12月,标本冻存于FRSQ呼吸健康网络生物样本库。RNA提取后与定制的人全基因组Affymetrix芯片杂交。数据可用于研究肺癌、慢性阻塞性肺疾病等肺部疾病的分子机制,支持转录组层面的比较分析与生物标志物探索(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们对非肿瘤人肺组织进行了全基因组基因表达谱分析。本项目的总体目标是加深我们对包括肺癌和慢性阻塞性肺疾病(COPD)在内的多种肺部疾病的分子理解。肺标本来自在Institut Universitaire de Cardiologie et de Pneumologie de Québec接受肺癌手术的患者。所有肺标本均取自2004年4月至2008年12月手术时获得的无肿瘤外周组织均质片段。这些肺组织保存在FRSQ呼吸健康网络生物样本库,站点为Institut Universitaire de Cardiologie et de Pneumologie de Québec。从手术切除到冷冻的时间为15至30分钟。提取RNA后,与单一定制的人全基因组Affymetrix芯片杂交。
【主题与分类】
主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-23352
下载信息
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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-23352
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
我们对非肿瘤性人肺组织进行了全基因组基因表达谱分析。本项目的总体目标是加深我们对包括肺癌和慢性阻塞性肺疾病(COPD)在内的多种肺部疾病的分子理解。肺标本取自于魁北克大学心肺研究所接受肺癌手术的患者。所有肺标本均来源于2004年4月至2008年12月期间手术获取的无肿瘤外周组织的均质片段。这些肺组织保存在FRSQ呼吸健康网络的生物样本库中,位于魁北克大学心肺研究所。从手术切除到冷冻的时间为15至30分钟。提取RNA后,将其与单一定制的人全基因组Affymetrix芯片进行杂交。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




