非肿瘤人肺组织全基因组基因表达谱：GRNG数据集
该数据集来自 omicsdi.org，收录非肿瘤人肺组织的全基因组基因表达谱，属于肿瘤/肺癌分类下的转录组学数据。样本取自多种肺部疾病患者的肺叶或肺组织，经切除后于-80C冻存并提取RNA，杂交至定制的人全基因组Affymetrix芯片
基本信息
资源简介
非肿瘤人肺组织全基因组基因表达谱：GRNG数据集
该数据集名为 Whole-genome gene expression profiles of non-tumorous human lung tissues: GRNG set，来源于 omicsdi.org，在肿瘤/肺癌分类下属于转录组学数据。其核心内容是对非肿瘤人肺组织进行全基因组基因表达谱分析，样本来自多种肺部疾病患者的肺叶或肺组织，经手术切除后取不参与诊断流程的组织冻存于-80C，随后提取RNA并杂交至定制的人全基因组Affymetrix芯片。该项目的总体目标是加深对包括肺癌和慢性阻塞性肺疾病（COPD）在内的多种肺部疾病的分子理解，为相关研究提供非肿瘤肺组织的表达谱资源。
【数据集背景】
该数据集聚焦于非肿瘤人肺组织的全基因组基因表达谱分析。项目设立的总体目标在于提升对多种肺部疾病分子机制的认识，所涉及的疾病包括肺癌和慢性阻塞性肺疾病（COPD）。通过采集非肿瘤肺组织并开展表达谱检测，该数据集旨在为肺部疾病研究提供分子层面的基础数据，帮助理解正常或非肿瘤状态下肺组织的基因表达特征，进而与疾病状态形成对照或参考。其分类归属于肿瘤/肺癌方向，但样本本身为非肿瘤组织，这一特点使其在肺癌等疾病研究中具有对照或背景参考价值。
【数据内容】
数据集包含非肿瘤人肺组织的全基因组基因表达谱。检测平台为定制的人全基因组Affymetrix芯片，通过将提取的RNA杂交至该芯片获得表达数据。样本来源于多种肺部疾病患者的肺叶或肺组织，具体涉及肺癌和COPD等疾病背景。数据主题标签为Transcriptomics，表明其属于转录组学范畴。整体数据内容围绕基因表达水平展开，覆盖全基因组范围，可用于分析非肿瘤肺组织中基因的表达模式。
【采集与来源】
样本采集自患有多种肺部疾病的患者。在手术切除后，选取肺叶或肺中不用于诊断工作流程的组织样本，将其冷冻并保存在-80C条件下。随后从这些冻存组织中提取RNA，并将RNA杂交至定制的人全基因组Affymetrix芯片。数据来源站为omicsdi.org。以上为源站描述中提供的采集与处理流程信息，未提及具体的样本数量、患者人口学特征、伦理审批细节或具体疾病亚型分布。
【适用场景】
该数据集适用于肺部疾病相关的转录组学研究，尤其是需要非肿瘤肺组织作为对照或参考的分析场景。由于项目目标涉及肺癌和慢性阻塞性肺疾病（COPD）的分子理解，该数据可用于比较非肿瘤组织与肿瘤组织之间的基因表达差异，或用于探索肺部疾病背景下非肿瘤组织的分子特征。此外，全基因组表达谱数据也可用于筛选候选基因、通路分析或作为独立数据集的验证参考。其转录组学属性使其适合基因表达层面的生物信息学分析。
【使用方法】
使用者可基于该数据集的全基因组基因表达谱开展下游分析。数据以定制Affymetrix芯片杂交结果的形式提供，通常需要借助芯片表达数据处理流程进行读取、标准化和注释。由于样本来自非肿瘤肺组织，使用时可结合疾病背景信息进行分组或对照设计。具体的数据下载方式、文件格式、预处理步骤及分析工具未在源站描述中说明，需参考源站提供的原始数据及配套文档。
【质量与限制】
源站描述中说明了样本冻存于-80C并经过RNA提取和芯片杂交，但未提供关于RNA质量、芯片数据质量评估、批次效应控制或数据归一化方法的具体信息。样本来自多种肺部疾病患者，但未说明各疾病的具体例数、年龄、性别、吸烟史等临床变量，这可能限制对混杂因素的控制和结果的泛化解释。此外，该数据集为非肿瘤肺组织表达谱，不包含肿瘤组织本身的表达数据，因此不能直接用于肿瘤与正常组织的配对比较，除非与其他数据集联合使用。其他质量相关指标及限制条件源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、许可协议或使用条款信息。使用者如需引用或使用该数据，应访问来源站omicsdi.org查询相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-23545
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们对非肿瘤性人肺组织进行了全基因组基因表达谱分析。本项目的总体目标是加深我们对包括肺癌和慢性阻塞性肺疾病（COPD）在内的多种肺部疾病的分子层面的理解。肺标本取自患有多种肺部疾病的患者。切除后，与诊断评估无关的肺叶或肺组织样本被冷冻并保存在-80℃条件下。提取RNA后，将其与单一定制的人全基因组Affymetrix芯片进行杂交。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
