基于FFPE组织miRNA表达谱验证I期非小细胞肺癌复发预测实验室检测

该数据集来自omicsdi.org,主题为转录组学,聚焦I期非小细胞肺癌(NSCLC)复发预测的实验室检测验证。数据基于福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织标本的miRNA表达谱,用于对预测NSCLC复发的miRNA检测方法进行技术验证

omicsdi
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基因组预测Transcriptomics
Validation of a laboratory assay for prediction of relapse in stage I non-small cell lung cancer (NSCLC) using miRNA profiling of formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue specimens.

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

基于FFPE组织miRNA表达谱验证I期非小细胞肺癌复发预测实验室检测

该数据集来自 omicsdi.org,主题为转录组学,聚焦 I 期非小细胞肺癌(NSCLC)复发预测的实验室检测验证。数据基于福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织标本的 miRNA 表达谱,用于对预测 NSCLC 复发的 miRNA 检测方法进行技术验证。数据集英文名称明确指向“使用 FFPE 组织标本 miRNA 表达谱验证 I 期非小细胞肺癌复发预测实验室检测”这一核心内容,本站将其归类于肿瘤 / 肺癌方向。整体而言,该数据集服务于转录组学层面的检测方法学验证,而非单纯的表达谱描述,其价值在于为基于 miRNA 的复发预测检测提供技术层面的验证依据。

【数据集背景】

非小细胞肺癌(NSCLC)是肺癌的主要类型之一,I 期患者的复发预测对于后续临床决策具有重要意义。基于 miRNA 表达谱的实验室检测被视为预测复发的一种技术路径,而此类检测在进入实际应用前需要经过技术验证。该数据集正是围绕这一需求构建,其英文名称直接表明研究目标是对用于预测 I 期 NSCLC 复发的实验室检测进行验证,验证对象为基于 FFPE 组织标本的 miRNA 表达谱检测方法。源站描述进一步将其概括为“NSCLC 复发预测 miRNA 检测的技术验证”,与数据集名称所表达的研究定位一致。

【数据内容】

该数据集的内容围绕 miRNA 表达谱展开,主题标签为 Transcriptomics(转录组学)。其数据来源于福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织标本,即通过对 FFPE 组织进行 miRNA 表达谱分析获得相关信息。数据集的核心内容并非泛泛的基因表达数据,而是服务于“复发预测检测验证”这一特定目的的技术验证数据。关于样本数量、miRNA 具体数目、表达矩阵格式、分组设计、随访信息等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据集的来源站为 omicsdi.org。其生物样本类型为福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织标本,检测对象为 miRNA 表达谱。FFPE 组织是临床病理存档的常见形式,以其作为检测材料符合实验室检测在实际场景中对样本可及性的要求。关于样本采集的具体机构、采集时间、伦理审批信息、测序或检测平台型号、试剂与流程细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与 I 期非小细胞肺癌复发预测相关的 miRNA 检测方法的技术验证场景,可用于评估基于 FFPE 组织 miRNA 表达谱的检测在预测复发方面的技术表现。其主题归属转录组学,也可作为转录组学层面 miRNA 检测方法学研究的参考数据。关于该数据集是否适用于其他癌种、其他分期或其他样本类型,源站未提供,不应据此扩展推断。

【使用方法】

该数据集可用于 miRNA 表达谱层面的检测验证分析,使用时应围绕“I 期 NSCLC 复发预测”这一目标定位理解数据。关于数据文件的具体格式、字段含义、预处理步骤、分析流程、配套代码或工具,源站未提供。使用者在引用或复用前,宜先核对源站页面所附的原始说明与数据文件描述。

【质量与限制】

该数据集定位为实验室检测的技术验证,其证据层级属于方法学验证范畴,不宜直接等同于临床效用证据。数据基于 FFPE 组织标本的 miRNA 表达谱,相关技术特征受标本类型与检测方法本身制约。关于样本量、缺失值情况、批次效应、验证设计细节及性能指标,源站未提供,因此无法对数据质量作进一步评估。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、文献出处、许可协议与使用限制,源站未提供。使用者在公开引用或再分发前,应查阅 omicsdi.org 对应条目以获取准确的引用与许可信息。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-618

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Technical validation of miRNA assay for prediction of relapse in NSCLC.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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