Triple SILAC 外泌体定量蛋白质组分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000079882

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

外泌体是细胞释放到细胞外空间的30-100纳米大小的膜囊泡，通过传递蛋白质和RNA介导细胞间通讯。为了更好地理解这些微囊泡在肺癌发生中的功能，我们采用三重SILAC定量蛋白质组学策略，检测了源自永生化正常支气管上皮细胞系与两种非小细胞肺癌(NSCLC)细胞系的外泌体之间的差异蛋白丰度，这两种NSCLC细胞系分别携带细胞信号分子Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(KRAS)或表皮生长因子受体(EGFR)的不同激活突变。我们成功量化了源自这三种细胞系的727种外泌体蛋白。与信号转导相关的蛋白在NSCLC外泌体中富集，这些外泌体在调节细胞增殖方面具有功能活性。本研究首次探讨了源自NSCLC细胞及其正常对应细胞的外泌体蛋白质丰度差异，并揭示了外泌体在NSCLC癌症进展中的作用，这可能对NSCLC患者生物标志物的开发具有临床意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。