NSCLC、GBM、CRC与PAAD的转录组比较

该数据集包含四种不同癌症类型的原始基因表达数据:非小细胞肺癌(NSCLC)、多形性胶质母细胞瘤(GBM)、结直肠癌(CRC)和胰腺腺癌(PAAD)

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基因组分类Medicine, Health and Life Sciences
Transcriptomic Comparison of NSCLC, GBM, CRC, and PAAD.

基本信息

模态
基因组
大小
0.05830714 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

NSCLC、GBM、CRC与PAAD的转录组比较

Transcriptomic Comparison of NSCLC, GBM, CRC, and PAAD.

该数据集包含四种不同癌症类型的原始基因表达数据:非小细胞肺癌(NSCLC)、多形性胶质母细胞瘤(GBM)、结直肠癌(CRC)和胰腺腺癌(PAAD)。数据通过GEO2R工具从Gene Expression Omnibus(GEO)获取,涵盖数千个基因在肿瘤与对照样本中的表达值。该原始数据集可作为下游分析的基础,例如归一化、差异基因表达分析和通路富集(来源 DOI 解析)。

【数据集背景】

源站首次发布:2025。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含四种不同癌症类型的原始基因表达数据:非小细胞肺癌(NSCLC)、多形性胶质母细胞瘤(GBM)、结直肠癌(CRC)和胰腺腺癌(PAAD)。数据通过GEO2R工具从Gene Expression Omnibus(GEO)获取,包含数千个基因在肿瘤与对照样本中的表达值。该原始数据集可作为下游分析的基础,例如归一化、差异基因表达分析和通路富集。

【主题与分类】

主题标签:Medicine, Health and Life Sciences。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://dataverse.harvard.edu/citation?persistentId=doi:10.7910/DVN/SQNAUR

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源站:https://doi.org/10.7910/DVN/SQNAUR

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 58.3 MB。

数据说明

该数据集包含四种不同癌症类型的原始基因表达数据:非小细胞肺癌(NSCLC)、多形性胶质母细胞瘤(GBM)、结直肠癌(CRC)和胰腺导管腺癌(PAAD)。数据通过GEO2R工具从基因表达综合数据库(GEO)获取,涵盖了数千个基因在肿瘤样本与对照样本中的表达值。此原始数据集为后续分析,如标准化处理、差异基因表达分析及通路富集分析,奠定了基础。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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