肺癌细胞过表达miR-34a的转录谱分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-38341

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Zeb1转录抑制因子通过下调那些强烈诱导上皮分化和抑制干性的基因，在转移过程中发挥关键作用。在此，我们报道Zeb1控制着众多致癌和抑癌微小RNA（miR）的表达。Zeb1通过下调miR-34a刺激促迁移的细胞骨架过程，并通过Arhgap1（一种Cdc42 GTP酶激活蛋白及新的miR-34a靶基因）激活Rho GTP酶。预后不良的人肺腺癌高度富集了一种由miR-34a下调激活的细胞骨架基因特征。这些发现表明，Zeb1调控一个miR网络，并通过miR-34a驱动促迁移的细胞骨架过程。从注射了344SQ载体和-miR-34a细胞的小鼠原发肿瘤中提取总RNA，然后与Affymetrix GeneChip Mouse Genome 430 2.0阵列杂交。进行了差异表达基因的测定。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。