HDAC抑制剂MS-275靶向肺癌新型SALL4/CBL-B通路

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-68959

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管已有靶向治疗手段，肺癌患者的总体生存率仍然不容乐观。癌胚蛋白SALL4是一个新的癌症靶点。我们在此报告，SALL4在部分生存期较短的肺癌患者中异常表达。通过RNA干扰沉默SALL4或使用SALL4肽抑制剂处理，均可导致肺癌细胞生长受损。对SALL4敲低细胞的表达谱分析显示，EGFR和IGF1R信号通路均受到影响。进一步研究表明，SALL4通过抑制CBL-B间接抑制这些通路。Connectivity Map分析显示，HDAC抑制剂MS-275是治疗SALL4表达型癌症的潜在药物，并使用17种肺癌细胞系对此进行了验证。总之，我们首次报告MS-275可以靶向肺癌中新的SALL4/CBL-B通路。这为未来临床研究评估MS-275在SALL4阳性肺癌患者中的治疗疗效奠定了基础。使用具有野生型乱序对照或Sall4敲低的人肺癌细胞系H661细胞进行RNA提取，并在Affymetrix微阵列上杂交。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。