靶向netrin抑制破坏DCC依赖通路并抑制神经内分泌肿瘤异种移植生长

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A8a605882464bf4b671f956b14cba0ab468cc57c7359e02d5e755b4a5f0292c4b

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DCC 作为抑癌基因发挥作用，并在多种肿瘤中发生改变，包括神经内分泌肿瘤。Netrin（NTN）-1 是 DCC 的主要配体。作为一种依赖性受体，DCC 在缺乏 NTN 时诱导细胞凋亡，而在 NTN 存在时促进细胞存活。在小细胞肺癌和神经母细胞瘤等特定癌症中，已观察到 NTN-3 而非 NTN-1 的上调。然而，NTNs 和 DCC 在 PNEN 中的确切作用仍不清楚。我们评估了胰腺神经内分泌肿瘤（PNEN）细胞（BON-1）中 DCC 和 netrin 的表达。我们通过 DCC 敲低和 netrin 抑制抗体 NP137 检测了 netrin 对细胞活力的影响。在体内，将 PNEN 细胞注射到裸鼠中，并用 NP137 或 PBS 处理。进行了肿瘤 RNA 测序。使用 TCGA 数据的基于人群的分析评估了 DCC 和 NTN3 表达对生存的影响。BON-1 细胞表现出 DCC 和 NTN-3 的表达升高。

添加NTN-1增强了BON1的活力，一项应答……，# 靶向netrin抑制可破坏DCC依赖通路并抑制神经内分泌肿瘤中的异种移植瘤生长 https://doi.org/10.5061/dryad.7sqv9s52d ## 数据与文件结构说明 在体内实验中，将BON1（PNEN）细胞注射到裸鼠体内，并用NP137或PBS处理。进行了肿瘤RNA测序。以下用于基因表达分析的.counts文件可供使用： 用NP137处理：\ Netrin_01.fqAligned.sortedByCoord.out.bam.counts Netrin_11.fqAligned.sortedByCoord.out.bam.counts Netrin_16.fqAligned.sortedByCoord.out.bam.counts 用PBS处理：\ Netrin_17.fqAligned.sortedByCoord.out.bam.counts Netrin_18.fqAligned.sortedByCoord.out.bam.counts ## 代码/软件 在R Studio上使用DESEQ2包，基于主要流程参数。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。