呼吸缺陷限制肺癌生长与存活所需的丝氨酸合成——Polg突变在NSCLC组织与血浆中的效应

ST003891 是一个来自 metabolomicsworkbench.org 的代谢组学数据集,收录分类为肿瘤 / 肺癌,研究物种为小鼠(Mus musculus),检测平台为 LC-MS,标题指向呼吸缺陷限制丝氨酸合成以及丝氨酸合成对肺癌生长和生存的必要性,并涉及 Polg 突变在非小细胞肺癌

Rutgers UniversityRutgers University
metabolomics_workbench
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其他分类LC-MS
ST003891: Respiration defects limit serine synthesis required for lung cancer growth and survival - Effect of Polg mutation in NSCLC Tissues_Plasma

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

呼吸缺陷限制肺癌生长与存活所需的丝氨酸合成——Polg突变在NSCLC组织与血浆中的效应

ST003891 是一个来自 metabolomicsworkbench.org 的代谢组学数据集,收录分类为肿瘤 / 肺癌,研究物种为小鼠(Mus musculus),检测平台为 LC-MS,标题指向呼吸缺陷限制丝氨酸合成以及丝氨酸合成对肺癌生长和生存的必要性,并涉及 Polg 突变在非小细胞肺癌组织与血浆中的效应。

【数据集背景】

从名称看,该数据集围绕肺癌代谢与呼吸功能相关机制展开,核心线索包括呼吸缺陷、丝氨酸合成、肺癌生长与生存,以及 Polg 突变在 NSCLC 组织和血浆中的影响。NSCLC 通常指非小细胞肺癌,是该数据集分类中的肺癌主题下的具体对象。研究机构为 Rutgers University。源站描述将其概括为代谢组学研究,采用 LC-MS,物种为 Mus musculus。除上述信息外,关于研究假设、实验设计、动物模型细节、突变类型、对照组设置、时间点、组织取材部位、血浆采集方式等,源站未提供。

【数据内容】

该数据集属于代谢组学数据,检测技术为液相色谱-质谱联用(LC-MS)。名称中出现 Tissues_Plasma,说明其标题涉及组织与血浆;但具体样本数量、分组方式、生物学重复、技术重复、样本制备流程、代谢物提取方法、色谱与质谱条件、原始数据格式、峰表、代谢物鉴定结果、定量结果以及统计比较结果等,源站未提供。该数据集与 LC-MS 主题相关,说明质谱采集是其核心数据形式之一;除此之外,数据文件清单、数据结构、元数据字段和注释信息,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 metabolomicsworkbench.org。源站描述显示,这是一项代谢组学研究,采用 LC-MS,物种为 Mus musculus,研究机构为 Rutgers University。该数据集在收录分类中归入肿瘤 / 肺癌。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批、动物饲养条件、仪器型号、色谱柱、流动相、离子源、扫描模式、碰撞能量、数据采集软件和数据处理软件等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于关注肺癌代谢重编程、丝氨酸合成、呼吸缺陷、Polg 突变以及组织与血浆代谢组学的分析场景。对于希望比较或复用 LC-MS 代谢组数据的研究者,可作为肺癌主题下的候选数据资源;若关注非小细胞肺癌相关代谢变化,该数据集的主题也具有参考价值。由于具体样本、代谢物和统计结果未在现有信息中给出,能否直接用于特定假设检验、标志物筛选、通路分析或跨物种比较,需结合源站提供的完整元数据与原始数据判断;源站未提供具体适用建议。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体下载方式、访问权限、数据预处理流程、推荐分析工具、参数设置、代码示例或结果复现步骤。一般而言,LC-MS 代谢组数据的使用通常涉及原始数据转换、峰检测、峰对齐、代谢物鉴定、归一化和统计分析等环节,但这些环节是否适用于本数据集、应如何执行,源站未提供。使用者可前往 metabolomicsworkbench.org 查阅该数据集的源页面,以获取源站可能提供的说明;源站未提供的部分无法从现有信息中补充。

【质量与限制】

源站未提供质量评估信息,包括但不限于样本量、缺失值比例、批次效应、技术误差、定量准确性、代谢物鉴定置信度、数据完整性、重复性和验证结果。由于物种为小鼠,且研究主题聚焦 NSCLC 相关机制,若将结论直接外推到人类或其他疾病模型,需要额外验证;这一点属于通用研究注意事项,源站未提供专门的质量声明。该数据集的具体限制、偏倚来源和适用范围,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、DOI、作者列表、许可协议、使用条款、商业使用限制或联系方式。数据来源站为 metabolomicsworkbench.org,研究机构为 Rutgers University;若需引用或使用,应先查阅源站页面上的引用与许可说明。除来源站名称、研究机构和物种、检测技术等信息外,关于授权与引用的具体要求,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST003891

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

代谢组学研究(LC-MS)。物种:小鼠。机构:罗格斯大学。

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