ST003581:基于MS LOC平台整合机器学习与唾液代谢指纹的肺癌快速无创早期检测:大规模多中心研究
ST003581 是一个以肺癌早期无创检测为目标的代谢组学研究数据集,其核心思路是把机器学习方法与唾液代谢指纹相结合,并借助 MS LOC 平台开展大规模多中心研究

基本信息
资源简介
ST003581:基于MS LOC平台整合机器学习与唾液代谢指纹的肺癌快速无创早期检测:大规模多中心研究
ST003581 是一个以肺癌早期无创检测为目标的代谢组学研究数据集,其核心思路是把机器学习方法与唾液代谢指纹相结合,并借助 MS LOC 平台开展大规模多中心研究。该数据集可在 metabolomicsworkbench.org 获取,在站内被归入肿瘤 / 肺癌类别。
【数据集背景】
肺癌是发病与死亡负担都很重的恶性肿瘤之一,早期阶段往往缺乏特异症状,因此如何在仍可干预的阶段把患者识别出来,一直是临床与转化研究的重点方向。传统上,肺癌筛查依赖影像学与组织病理等手段,而这些手段在普及性、依从性和侵入性方面各有局限。代谢组学从内源性小分子出发刻画机体状态,为寻找可用于早期判别的分子特征提供了另一条路径。与此同时,唾液等易于获取的生物样本因采集过程无创、可重复采样而受到关注,若能在唾液这一基质中稳定捕捉到与疾病相关的代谢变化,就有望支撑更易推广的筛查策略。该研究正是围绕这一思路展开,研究对象物种为人(Homo sapiens),涉及机构为附属杭州市第一人民医院与西湖大学。
【数据内容】
源站把该数据集描述为一项代谢组学研究,检测类型标注为直接进样质谱(MS(Dir. Inf.)),即样品不经色谱分离而直接进入质谱检测。这一技术路线在代谢组学中常用于快速获取整体代谢指纹,通常配合高分辨质谱获取精确质量信息。至于该数据集包含的样本数量、受试者分组与临床信息、检测到的代谢物数目与鉴定结果、数据文件的组织方式与格式,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自 metabolomicsworkbench.org。源站描述显示其研究对象为人,涉及机构为附属杭州市第一人民医院与西湖大学,检测手段为直接进样质谱。关于样本采集的具体流程、样本量、纳入与排除标准、采样时间点、伦理审批信息以及仪器采集参数,源站未提供。
【适用场景】
结合数据集标题所反映的研究定位,其内容可能对关注肺癌早期无创筛查、唾液代谢标志物挖掘、机器学习分类建模以及直接进样质谱分析的研究者具有参考价值,也可作为方法学比较中的一类案例,用于探讨代谢指纹与疾病判别之间的关系。数据是否适合用于特定建模任务或临床决策支持,仍需以原始研究的设计与说明为准;源站未提供针对具体应用场景的推荐。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用说明、下载方式与文件说明。一般来说,使用公开的代谢组学数据时,研究者需要先了解原始数据的格式与预处理流程,再结合自身分析目的进行缺失值处理、归一化与统计或机器学习建模,并注意不同批次与不同中心之间可能存在的技术差异。就本数据集而言,是否附带分析代码、代谢物注释文件或元数据表,源站未提供。
【质量与限制】
该研究定位为大规模多中心研究,这类设计在样本来源的多样性上通常具有优势,但同时也需要考虑中心间差异对结果的影响。具体到本数据集,其质量控制指标、缺失率、重复性评估、外部验证情况以及结论的适用范围,源站未提供,使用者应结合原始研究文献自行判断。此外,机器学习模型的性能高度依赖训练数据构成与验证策略,仅凭数据本身不足以判断其临床可用性。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、文献出处与许可条款。如需要在研究中使用,建议访问 metabolomicsworkbench.org 上的原始条目,查阅其附带的引用信息与使用规定。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST003581
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
代谢组学研究(MS(Dir. Inf.))。物种:Homo sapiens。机构:西湖大学附属杭州市第一人民医院。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




