ST000388:血清磷脂酰乙醇胺水平区分良恶性孤立性肺结节并作为肺癌潜在诊断生物标志物(第一部分)
数据聚焦血清磷脂酰乙醇胺水平,用于区分良性孤立性肺结节与恶性孤立性肺结节,并探索其作为肺癌潜在诊断生物标志物的价值。该数据可用于肺癌相关代谢标志物筛选、良恶性肺结节鉴别诊断建模等研究,属于肿瘤/肺癌方向(来源 metabolomicsworkbench.org)

基本信息
资源简介
ST000388:血清磷脂酰乙醇胺水平区分良恶性孤立性肺结节并作为肺癌潜在诊断生物标志物(第一部分)
ST000388 数据集聚焦于血清磷脂酰乙醇胺水平的代谢组学研究,旨在区分良性孤立性肺结节与恶性孤立性肺结节,并探索其作为肺癌潜在诊断生物标志物的价值。该数据集来源于代谢组学工作台(metabolomicsworkbench.org),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术,研究对象为人类(Homo sapiens),研究机构为加州大学戴维斯分校。数据集属于肿瘤/肺癌方向,主题标签为LC-MS。整体而言,该数据集可用于肺癌相关代谢标志物筛选、良恶性肺结节鉴别诊断建模等研究,为肺癌的早期诊断和鉴别诊断提供代谢层面的数据支持。
【数据集背景】
肺癌是全球范围内发病率和死亡率较高的恶性肿瘤之一,早期诊断对改善患者预后至关重要。孤立性肺结节是肺癌筛查中常见的影像学表现,但良性与恶性结节在影像学上往往难以区分,导致不必要的侵入性检查或延误治疗。因此,寻找能够辅助鉴别诊断的生物标志物成为研究热点。代谢组学通过系统分析生物样本中的小分子代谢物,能够反映机体在病理状态下的代谢重编程。磷脂酰乙醇胺作为细胞膜的重要组成成分,参与多种细胞过程,其血清水平的变化可能与肺癌的发生发展相关。该数据集正是基于这一背景,探索血清磷脂酰乙醇胺水平在良恶性孤立性肺结节鉴别中的潜在价值。
【数据内容】
该数据集为代谢组学研究数据,采用LC-MS技术对血清样本进行检测,重点关注磷脂酰乙醇胺类代谢物。数据集英文名称为“ST000388: Serum phosphatidylethanolamine levels distinguish benign from malignant solitary pulmonary nodules and represent a potential diagnostic biomarker for lung cancer (part I)”,表明其内容涉及血清磷脂酰乙醇胺水平的测定,并用于区分良性孤立性肺结节与恶性孤立性肺结节。数据集属于肿瘤/肺癌分类,主题标签为LC-MS。关于样本数量、具体代谢物种类、浓度数值、统计结果等详细信息,源站未提供。
【采集与来源】
该数据来源于代谢组学工作台(metabolomicsworkbench.org),研究机构为加州大学戴维斯分校(University of California, Davis)。研究对象为人类(Homo sapiens)。数据采集采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术,属于代谢组学分析。源站描述仅提及“Metabolomics study (LC-MS). Species: Homo sapiens. Institute: University of California, Davis.”,未提供更详细的样本采集流程、伦理审批信息、样本处理步骤等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肺癌相关代谢标志物筛选研究,特别是针对血清磷脂酰乙醇胺水平的分析。可用于良恶性孤立性肺结节鉴别诊断建模,例如构建分类模型以区分良性结节与恶性结节。此外,该数据还可用于探索磷脂酰乙醇胺作为肺癌潜在诊断生物标志物的价值,支持代谢组学与临床诊断相结合的研究。由于数据集属于肿瘤/肺癌方向,也可用于肺癌代谢重编程机制的基础研究。具体应用时需结合LC-MS数据特点进行预处理和统计分析。
【使用方法】
使用该数据集时,研究者可基于LC-MS代谢组学数据进行分析。通常流程包括数据预处理(如峰识别、对齐、归一化)、代谢物鉴定与定量、统计分析(如差异代谢物筛选、分类模型构建)等。由于数据集聚焦于血清磷脂酰乙醇胺水平,可重点提取该类代谢物的信号进行良恶性分组比较。具体的数据格式、文件结构、分析工具建议等,源站未提供。建议参考代谢组学工作台的标准使用指南或相关文献。
【质量与限制】
该数据集来源于代谢组学工作台,研究机构为加州大学戴维斯分校,采用LC-MS技术,具有一定的科学可靠性。然而,源站未提供样本量、数据完整性、缺失值比例、批次效应校正情况、验证集信息等质量指标。此外,数据集名称中标注为“part I”,可能表明存在后续部分,但源站未提供具体说明。使用时应考虑代谢组学数据的常见限制,如技术重复性、生物学变异、代谢物鉴定置信度等。由于缺乏详细的质量控制信息,建议使用者谨慎评估数据适用性。
【引用与许可】
该数据集的来源站为metabolomicsworkbench.org,具体引用方式、许可协议、使用条款等信息源站未提供。使用者应遵循代谢组学工作台的相关规定,并引用原始研究。由于源站未提供明确的许可信息,建议直接访问该平台获取最新引用和许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST000388
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Metabolomics study (LC-MS). Species: Homo sapiens. Institute: University of California, Davis.
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




