小细胞肺癌患者tarlatamab治疗前后微流控富集循环肿瘤细胞的单细胞RNA-seq

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-16413

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本单细胞RNA测序实验旨在定量小细胞肺癌患者循环肿瘤细胞中DLL3的表达，以预测对tarlatamab治疗的反应。使用CTC-iChip从三名小细胞肺癌患者接受tarlatamab治疗前或治疗后的血液中富集循环肿瘤细胞，随后通过磁珠去除红细胞，再使用10x Genomics Chromium平台（Chromium GEM-X单细胞3’试剂盒v4）进行处理，并在NextSeq 2000系统上测序。对应的EGA研究编号：EGAS50000001401，EGA数据集编号：EGAD50000002035

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。