RNA-seq研究多ERBB抑制剂Neratinib处理KRAS突变NCI-H358肺腺癌细胞的影响
数据为 RNA-seq,用于研究多 ERBB 抑制剂 Neratinib 处理 KRAS 突变的人肺癌细胞系 NCI-H358 后的转录影响

基本信息
资源简介
RNA-seq研究多ERBB抑制剂Neratinib处理KRAS突变NCI-H358肺腺癌细胞的影响
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/肺癌分类,主题标签为 Transcriptomics。数据为 RNA-seq,用于研究多 ERBB 抑制剂 Neratinib 处理 KRAS 突变的人肺癌细胞系 NCI-H358 后的转录影响。源站描述指出,KRAS 突变常被认为可使细胞摆脱上游 RTK 信号依赖,但小鼠肺癌模型的新证据提示 ERBB RTK 可能放大 RAS 亚型信号并参与突变 RAS 驱动的肺癌;这是考察 Neratinib 处理 KRAS 突变人肺癌细胞系转录影响的 3 个数据集之一。可用于分析药物处理后的基因表达变化及相关信号通路研究(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):KRAS 突变被广泛认为可使细胞摆脱上游 RTK 信号的依赖,然而来自小鼠肺癌模型的新证据表明,ERBB RTK 可能放大通过 RAS 亚型的信号传导,并参与突变 RAS 驱动的肺癌。这是 3 个数据集之一,我们在这些数据集中检查了多 ERBB 抑制剂 Neratinib 处理 KRAS 突变人肺癌细胞系后的转录影响。
【主题与分类】
主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-6485
下载信息
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数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-6485
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
KRAS突变被广泛认为可使肿瘤细胞摆脱对上游RTK信号的依赖,然而来自肺癌小鼠模型的新证据表明,ERBB RTK可能通过RAS亚型放大信号,并参与突变RAS驱动的肺癌。这是我们研究的3个数据集之一,在这些数据集中,我们检测了使用多ERBB抑制剂来那替尼(Neratinib)处理KRAS突变人肺癌细胞系后的转录影响。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




