新诊断未治疗NSCLC伴恶病质患者与健康对照股外侧肌活检RNA-seq
该数据集来自 omicsdi.org，收录新诊断、未接受治疗的 NSCLC 伴恶病质患者（n=8）与年龄、性别匹配的健康对照（n=8）的股外侧肌活检 RNA 测序数据，测序平台为 Illumina NovaSeq 6000
基本信息
资源简介
新诊断未治疗NSCLC伴恶病质患者与健康对照股外侧肌活检RNA-seq
该数据集为股外侧肌活检 RNA 测序数据，研究对象包括新诊断、未接受治疗的伴恶病质非小细胞肺癌（NSCLC）患者与年龄、性别匹配的健康对照。患者组与对照组各 8 例，通过自我报告的体重下降情况及身体成分测量来判定恶病质状态。测序在 Illumina NovaSeq 6000 平台上完成，数据主题属于转录组学。该数据集来源于 omicsdi.org，本站分类为肿瘤 / 肺癌。整体来看，该资源可用于探索肺癌恶病质状态下骨骼肌基因表达谱及受调控通路，为理解恶病质相关的肌肉消耗机制提供转录组层面的数据基础。
【数据集背景】
癌症恶病质在肺癌中高度流行，是一种以骨骼肌质量非自主性丢失为特征的衰弱综合征，并与不良临床结局、生存期缩短以及对肿瘤治疗的负面影响相关。该数据集的研究目的在于识别恶病质状态下受调控的肌肉基因谱和通路。研究对象聚焦于新诊断、未接受治疗的 NSCLC 患者，并设置年龄、性别匹配的健康对照，以减少年龄和性别因素对肌肉基因表达比较的干扰。恶病质状态的判定结合了自我报告的体重下降和身体成分测量。该数据集的主题标签为 Transcriptomics，表明其核心数据类型为转录组学数据。
【数据内容】
该数据集包含股外侧肌活检样本的 RNA 测序数据。样本来自新诊断、未接受治疗的伴恶病质 NSCLC 患者（n = 8）以及年龄、性别匹配的健康对照（n = 8）。测序平台为 Illumina NovaSeq 6000。数据可用于分析肌肉组织中的基因表达谱，并进一步识别在恶病质状态下受到调控的生物学通路。数据集来源站为 omicsdi.org，本站分类为肿瘤 / 肺癌。除上述信息外，源站未提供关于数据文件类型、数据量、原始数据与处理后数据的具体构成等更多细节。
【采集与来源】
样本采集部位为股外侧肌，采集方式为肌肉活检。研究对象包括新诊断、未接受治疗的 NSCLC 伴恶病质患者，以及年龄、性别匹配的健康对照。恶病质状态通过自我报告的体重下降和身体成分测量进行定义。RNA 测序在 Illumina NovaSeq 6000 平台上完成。数据来源站为 omicsdi.org。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、知情同意流程以及样本处理与建库细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肺癌恶病质相关的骨骼肌转录组研究，可用于比较伴恶病质 NSCLC 患者与年龄、性别匹配健康对照之间股外侧肌的基因表达差异，识别恶病质状态下受调控的肌肉基因谱和通路。也可作为探索癌症恶病质导致骨骼肌质量丢失机制的转录组数据资源。其主题标签为 Transcriptomics，适合转录组学分析场景。关于该数据集是否适用于其他癌种、其他肌肉类型或其他临床结局的预测，源站未提供相关信息。
【使用方法】
该数据集为 RNA 测序数据，测序平台为 Illumina NovaSeq 6000。使用时可围绕股外侧肌活检样本的基因表达谱开展转录组分析，并结合恶病质状态分组进行比较。分组信息包括伴恶病质的新诊断、未接受治疗 NSCLC 患者（n = 8）与年龄、性别匹配的健康对照（n = 8）。关于具体的下载方式、数据格式、预处理流程、标准化方法、分析工具或代码，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的样本量较小，患者组与对照组各 8 例。恶病质状态通过自我报告的体重下降和身体成分测量定义。研究对象为新诊断、未接受治疗的 NSCLC 患者，并设置年龄、性别匹配的健康对照，测序平台为 Illumina NovaSeq 6000。关于数据质量指标、测序深度、reads 数、比对率、批次效应、缺失值情况以及潜在偏倚，源站未提供。关于该数据集能否外推至更广泛人群或其他疾病阶段，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 omicsdi.org，本站分类为肿瘤 / 肺癌。关于引用方式、原始文献、作者列表、发表期刊、DOI、数据许可协议、使用限制或访问权限，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-12781
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
癌症恶病质在肺癌中极为普遍，是一种以不自主骨骼肌质量丢失为特征的衰弱综合征，与不良临床结局、生存率降低及对肿瘤治疗的负面影响相关。本研究旨在识别恶病质状态下受调控的肌肉基因表达谱及通路。我们获取了新诊断、未经治疗的伴有恶病质的非小细胞肺癌患者（n = 8）及相匹配的健康对照者（n = 8）的股外侧肌组织。通过自我报告的体重下降及身体成分测量来界定恶病质状态。RNA测序在Illumina NovaSeq 6000平台上进行。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
