RBM5、RBM6和RBM10调控NUMB可变剪接控制癌细胞增殖

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-47431

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

RBM5作为凋亡基因可变剪接的调控因子，及其近缘同源物RBM6和RBM10，是属于常在肺癌中缺失或突变的RNA结合蛋白。我们发现RBM5/6与RBM10拮抗性地调节癌细胞的增殖能力，并在可变剪接调控中展现出不同的位置效应。我们确定Notch通路调节因子NUMB是这些因子在控制细胞增殖中的关键靶点。NUMB的可变剪接，在肺癌中常发生改变，能够调节集落形成和异种移植肿瘤的形成，其调节作用能够重现或拮抗RBM5、6和10在细胞集落形成中的效果。在肺癌细胞中发现的RBM10突变会破坏NUMB剪接调控，从而促进细胞生长。我们的研究结果揭示了一个控制癌细胞增殖的关键遗传回路。研究使用了来自RBM5、6和10敲减的3个生物学重复及对照组的RNA。通过使用剪接接头阵列（Affymetrix HJAY）测量对照组与敲减组之间的变化。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。