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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1519743：遗传与生化筛选鉴定 MGAT1 为 STK11 突变肺癌的可成药糖基转移酶靶点

该数据集为 NCBI BioProject 数据库中的一项生物项目记录，编号 PRJNA1519743，英文标题为“Genetic and biochemical screens identify MGAT1 as a druggable glycosyltransferase target in STK11-mutant lung cancer”。从标题可以看出，该项目围绕 STK11 突变型肺癌展开，通过遗传筛选与生化筛选相结合的研究策略，鉴定出 MGAT1 作为一种可成药的糖基转移酶靶点。数据集在分类上归属于肿瘤 / 肺癌方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，主题标签为“Other”。BioProject 记录本身是围绕某一项研究计划而汇集多种类型生物数据的统一入口，便于用户集中查找该项目所产生的各类数据及其关联链接。

【数据集背景】

该数据集所对应的研究计划聚焦于 STK11 突变型肺癌。STK11 突变是肺癌中一类具有特定分子特征的亚型，寻找其可干预的分子靶点具有潜在的研究价值。该项目采用遗传与生化两种筛选手段，旨在系统性地识别与 STK11 突变肺癌相关的可成药靶点，并最终将 MGAT1 这一糖基转移酶确定为候选目标。BioProject 作为 NCBI 提供的项目级记录，用于整合由单一机构或联合体发起的同一项研究计划下产生的多样化生物数据，使用户能够从一个统一位置获取该计划所涉及的不同数据类型及其链接。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Other”，其核心内容围绕“通过遗传与生化筛选鉴定 MGAT1 作为 STK11 突变肺癌中的可成药糖基转移酶靶点”这一研究主题展开。作为 BioProject 记录，它提供的是项目层面的索引与聚合信息，用于指向该项目所产生的各类生物数据。关于该项目具体包含哪些数据文件、样本数量、测序类型或分析结果等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的一条记录，项目编号为 PRJNA1519743。BioProject 记录通常由单一组织或联合体提交，用于汇集与同一研究计划相关的生物数据。关于该项目的具体提交机构、样本采集方式、实验流程及数据处理步骤，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与 STK11 突变型肺癌相关的研究场景，尤其是关注可成药靶点发现、糖基转移酶功能以及遗传与生化筛选策略的研究人员。用户可借助该 BioProject 记录定位该项目所关联的各类生物数据，用于靶点验证、机制探索或后续药物开发研究。关于该数据集在特定分析流程或临床场景中的具体适用性，源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 PRJNA1519743 检索并访问该记录。BioProject 记录的设计目的是为用户提供一个统一入口，以便查找该项目所产生的不同数据类型及其链接。关于如何下载、解析或二次利用该项目具体数据文件的步骤，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI BioProject 项目级记录，其质量与完整性取决于提交方所提供的信息。当前可确认的信息包括项目编号、英文标题、分类、来源站及主题标签。关于数据的具体质量评估指标、覆盖范围、潜在偏倚或使用限制，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 PRJNA1519743。关于该数据集的正式引用格式、许可条款或使用条件，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE345281

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1519743

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

检查点抑制剂是非小细胞肺癌（NSCLC）的标准治疗疗法，但其在STK11突变肿瘤中的疗效有限，凸显了对新治疗策略的需求。在此，我们进行了互补的体内和体外CRISPR-Cas9功能基因组筛选，以识别那些缺失后能恢复对抗PD-1治疗敏感性的基因。我们发现，MGAT1的缺失——一种高尔基体糖基转移酶，对高甘露糖N-聚糖成熟为杂合和复杂聚糖结构至关重要——在携带STK11突变的同源小鼠肿瘤模型中逆转了对抗PD-1治疗的耐药性。与抗原匹配的CD8+ T细胞进行的平行共培养筛选进一步表明，N-糖基化的破坏强烈敏化肿瘤细胞对T细胞介导的杀伤。遗传拯救研究表明，这种免疫逃逸表型依赖于MGAT1催化活性，支持对该酶进行直接的生化探究。

我们利用纯化的人源MGAT1和UDP-Glo™糖基转移酶检测法，建立了一个易于操作的筛选平台，并进行了50万化合物的生化高通量筛选，鉴定出初始命中化合物（化合物1；IC50 = 197 μM）。随后的药物化学优化逐步获得了活性更强的类似物，包括TNG-9333（0.814 μM）和TNG-2673（0.043 μM），与起始命中化合物相比，生化活性提高了1000倍以上。人源MGAT1在无配体、UDP结合、UDP-GlcNAc结合以及抑制剂结合状态下的晶体结构，结合SPR和DSF分析，揭示该化学系列作用于一个此前未被认识到的变构口袋，并通过UDP非竞争性机制抑制MGAT1。总之，我们的工作表明N-糖基化是免疫逃逸的关键介质，并确立MGAT1作为一个可配体化、结构上可处理的小分子药物发现靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别