PC9肺癌细胞PAR-CLIP测序鉴定FUS结合位点
该数据集为NCBI BioProject收录的PRJNA1490249项目，针对PC9肺癌细胞开展PAR-CLIP测序，用于鉴定FUS蛋白的结合位点
基本信息
资源简介
PC9肺癌细胞PAR-CLIP测序鉴定FUS结合位点
PRJNA1490249 是 NCBI BioProject 收录的一个生物项目，全称为“PAR-CLIP-sequencing of PC9 lung cancer cells to identify FUS bingind sites”。该项目以 PC9 肺癌细胞为研究对象，采用 PAR-CLIP 测序技术，目标在于鉴定 FUS 蛋白在细胞内的结合位点。BioProject 作为生物数据的集合记录，将围绕同一研究计划产生的多种数据类型汇聚于一处，便于用户集中查找与访问。该数据集在本站归入肿瘤 / 肺癌分类，主题标签为 Other，其短描述概括为：针对 PC9 肺癌细胞开展 PAR-CLIP 测序，用于鉴定 FUS 蛋白的结合位点。整体而言，这是一个聚焦 RNA 结合蛋白与肺癌细胞相互作用的测序项目记录。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库，项目编号为 PRJNA1490249。BioProject 的定位是汇集与单一研究计划相关的生物数据，这些数据可以来自一个机构或一个联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口，用以发现该项目所产生的不同类型数据之间的链接。本项目的研究对象是 PC9 肺癌细胞，研究手段是 PAR-CLIP 测序，研究目的是识别 FUS 蛋白的结合位点。本站将其归入肿瘤 / 肺癌分类，主题标签为 Other。
【数据内容】
依据源站标题与短描述，该数据集的核心内容是针对 PC9 肺癌细胞进行的 PAR-CLIP 测序，用于鉴定 FUS 蛋白的结合位点。BioProject 记录本身并不直接等同于原始测序数据文件，而是提供指向该项目所生成的各种数据类型的链接入口。关于具体的样本数量、测序读长、数据文件格式、数据量大小等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的一条项目记录。项目英文名称为 PRJNA1490249: PAR-CLIP-sequencing of PC9 lung cancer cells to identify FUS bingind sites。源站描述指出，BioProject 是来自单一机构或联合体的、与单一研究计划相关的生物数据集合，并为用户提供查找该项目多种数据类型链接的统一位置。关于样本采集的具体时间、地点、操作流程以及测序平台等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与 FUS 蛋白结合位点鉴定相关的研究场景，尤其是以 PC9 肺癌细胞为模型的研究。PAR-CLIP 测序通常用于在转录组范围内定位 RNA 结合蛋白的结合位点，因此该项目可用于支持对 FUS 蛋白在肺癌细胞中结合特征的分析。此外，由于 BioProject 记录汇聚了同一项目的多种数据类型链接，该数据集也可作为查找和获取相关数据的入口，服务于肿瘤学、肺癌研究以及 RNA 结合蛋白研究等领域。关于更具体的适用场景，源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问编号为 PRJNA1490249 的项目记录，并借助该记录提供的链接查找该项目生成的不同类型数据。BioProject 的设计目的正是为用户提供一个单一位置，以便发现与该项目相关的多种数据类型的链接。关于数据下载、处理和分析的具体步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于公开数据库中的项目记录。其标题与短描述明确指向 PC9 肺癌细胞的 PAR-CLIP 测序及 FUS 结合位点鉴定。需要指出的是，BioProject 记录本身是数据集合的索引性记录，而非直接的数据质量评估报告。关于该数据集的样本质量、测序质量、覆盖度、重复性等具体质量指标，以及使用上的限制条件，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 数据库，项目编号为 PRJNA1490249。关于该数据集的引用方式、许可条款或使用协议，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1490249
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
非小细胞肺癌(NSCLC)伴有软脑膜转移(LM)的预后极差。LM进展的调控因素仍不明确，从而阻碍了有效的临床干预。在此，我们发现肉瘤融合蛋白(FUS)的缺失促进了肺细胞系中的LM。由于FUS是一种参与转录的多功能DNA/RNA结合蛋白，我们在PC9细胞中利用PAR-CLIP-seq(光激活核糖核苷增强交联与免疫沉淀，随后进行高通量测序)探索了它如何抑制CD36。总体设计：使用FUS抗体偶联磁珠对PC9细胞进行免疫沉淀后的CLIP-seq分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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