基本信息

模态

蛋白质

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1477583：H3K36M 抑制 NSD2 激活 SETD2 依赖的抗病毒样免疫反应（KRAS 驱动肺癌）

PRJNA1477583 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的生物学研究项目，其英文全称为“The H3K36M oncohistone inhibits NSD2 to activate a SETD2-dependent antiviral-like immune response in KRAS-driven lung cancer”。该项目围绕 KRAS 驱动的肺癌展开，聚焦于 H3K36M 组蛋白突变（即 oncohistone，肿瘤组蛋白）如何抑制 NSD2，并进一步激活依赖 SETD2 的抗病毒样免疫反应。从本站分类来看，该数据集归属于肿瘤 / 肺癌方向，主题标签为“Other”。BioProject 作为生物数据的集合记录，旨在将同一项研究计划所产生的多种数据类型汇聚于一处，便于用户集中查找与访问。该数据集为研究 KRAS 驱动肺癌中组蛋白修饰异常与免疫应答之间关联提供了项目层面的索引与入口。

【数据集背景】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 数据库。BioProject 是围绕单一研究计划或由单一机构、联盟发起的生物数据集合，其记录为用户提供统一入口，以查找该项目所产生的多种数据类型。本项目的研究背景涉及 KRAS 驱动的肺癌，并关注 H3K36M 这一组蛋白突变形式。H3K36M 作为一种 oncohistone，在本项目中被描述为能够抑制 NSD2，并激活依赖 SETD2 的抗病毒样免疫反应。这一背景将肿瘤组蛋白突变、表观遗传调控因子与免疫反应联系起来，构成本数据集所对应研究计划的核心问题。

【数据内容】

该数据集为一项 BioProject 记录，其内容指向与上述研究计划相关的多种生物数据类型。源站描述指出，BioProject 记录提供用户单一位置以查找为该计划生成的不同数据类型。就本数据集而言，其具体包含哪些类型的数据文件、样本数量、测序平台或分析结果，源站未提供。本站分类将其归入肿瘤 / 肺癌，主题标签为“Other”。短描述进一步概括了项目主题：围绕 KRAS 驱动的肺癌，研究 H3K36M 组蛋白突变如何抑制 NSD2，并激活依赖 SETD2 的抗病毒样免疫反应。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 的 BioProject 数据库。其英文名称中包含项目编号 PRJNA1477583，源站标题为“The H3K36M oncohistone inhibits NSD2 to activate a... (ID 1477583) - BioProject - NCBI”。关于具体的采集方法、实验设计、样本来源、时间范围或机构信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与 KRAS 驱动肺癌、H3K36M 组蛋白突变、NSD2 抑制以及 SETD2 依赖的抗病毒样免疫反应相关的研究场景。由于 BioProject 记录本身是项目层面的索引，用户可借助它定位该研究计划所产生的多种数据类型。具体的使用场景，如是否用于差异表达分析、表观遗传分析或免疫通路研究，源站未提供。

【使用方法】

作为 BioProject 记录，该数据集的使用方式是通过其统一入口查找与该项目相关的不同数据类型。用户可依据项目编号 PRJNA1477583 在 NCBI BioProject 数据库中检索并访问该记录。关于具体的数据下载方式、分析流程或工具要求，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 BioProject 项目记录，其质量与限制取决于源站所汇集的各数据类型。源站描述仅说明 BioProject 是生物数据的集合，并提供查找多种数据类型的单一位置。关于数据完整性、准确性、覆盖度或技术偏差等具体质量指标，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为 PRJNA1477583: The H3K36M oncohistone inhibits NSD2 to activate a SETD2-dependent antiviral-like immune response in KRAS-driven lung cancer。关于具体的引用格式、许可条款或使用限制，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE335211

访问原始数据

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1477583

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

组蛋白3第36位赖氨酸(H3K36)或其附近的突变通过限制H3K36导向的甲基转移酶，在多种肿瘤类型中具有显性致癌效应。与此相悖的是，我们发现H3K36M癌组蛋白的表达出乎意料地抑制了KRAS驱动的肺腺癌肿瘤形成，这是通过诱导强大的免疫介导的肿瘤清除实现的。在机制上，癌组蛋白的表达去抑制内源性逆转录病毒元件的转录，导致双链RNA(dsRNA)的积累，并激活一种先天抗病毒样免疫反应，从而根除肿瘤生长。令人惊讶的是，虽然H3K36二甲基转移酶NSD2的失活复制了癌组蛋白表达的所有效应，但H3K36三甲基转移酶SETD2的失活则废除了元件去抑制以及由癌组蛋白表达所诱导的所有相关下游抗癌效应。这些观察结果重构了我们对H3K36甲基化作用、其在癌症中失调后果的理解，并塑造了我们对靶向H3K36甲基转移酶治疗干预的预期。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别