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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

树突状细胞介导的抗原呈递调控癌症中三级淋巴结构发育

PRJNA1430408 是 NCBI BioProject 数据库收录的一个生物项目，其英文名称为“Dendritic cell-mediated antigen presentation regulates tertiary lymphoid structure development in cancer.”。从名称可以看出，该项目聚焦于癌症背景下树突状细胞介导的抗原呈递过程，以及这一过程如何调控三级淋巴结构的发育。本站将该数据集归类为肿瘤 / 肺癌方向，主题标签为“Other”。该项目的源站标题在 NCBI BioProject 页面上以“Dendritic cell-mediated antigen presentation regul... (ID 1430408)”的形式呈现，用户可通过该编号在 NCBI 站点定位到对应的项目记录。整体而言，这是一个与肿瘤免疫微环境、树突状细胞功能及三级淋巴结构形成机制相关的生物项目资源。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种资源组织方式，用于汇集与某一项单一研究计划相关的各类生物数据。按照 NCBI 的说明，一个 BioProject 记录来源于单一机构或联合体，并为用户提供一个统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。PRJNA1430408 正是在这一框架下建立的记录，其研究主题围绕树突状细胞介导的抗原呈递对癌症中三级淋巴结构发育的调控作用。本站将其归入肿瘤 / 肺癌分类，说明该数据集在应用方向上与肿瘤学、尤其是肺癌研究存在关联。主题标签标注为“Other”，表明其在 NCBI 的主题分类体系中未被归入更具体的既有类别。

【数据内容】

源站未提供该项目所包含的具体数据类型、样本数量、物种信息、测序平台或文件格式等细节。已知信息仅表明它是一个 BioProject 记录，用于汇集与单一研究计划相关的生物数据。该项目的英文名称提示其研究内容涉及树突状细胞、抗原呈递、三级淋巴结构发育以及癌症等关键词，但项目内部具体包含哪些实验数据、分析结果或附属文件，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心（NCBI）的官方网站。项目编号为 PRJNA1430408，属于 NCBI BioProject 数据库中的一条记录。源站描述指出，BioProject 记录本身并不直接等同于某一类具体数据，而是作为查找该项目所产生多种数据类型的统一入口。关于该项目的样本采集方式、实验设计、受试对象来源、伦理审批信息或数据提交机构等，源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集适用于与肿瘤免疫、树突状细胞生物学、抗原呈递机制以及三级淋巴结构发育相关的研究场景。由于本站将其归类为肿瘤 / 肺癌方向，它可能对肺癌免疫微环境研究、肿瘤免疫治疗相关的基础探索具有参考价值。主题标签“Other”提示其在 NCBI 的主题体系中属于其他类别，用户在检索时可能需要结合项目名称中的关键词进行定位。具体适用于哪些分析流程、能否用于特定类型的二次分析，源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 PRJNA1430408 或项目英文名称中的关键词进行检索，进入该项目的记录页面。BioProject 记录的设计目的之一，就是为用户提供一个单一入口，以便找到该项目所生成的多种数据类型。因此，使用者可以借助该记录页面进一步跳转或链接到与之关联的数据资源。关于具体的数据下载方式、访问权限、是否需要申请、是否有配套的分析工具或流程，源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于该数据集质量控制、数据完整性、覆盖度、误差水平或验证方式的信息。由于当前可获取的信息仅限于项目名称、编号、来源站及分类标签，无法对该数据集的数据质量做出具体判断。此外，该项目在 NCBI 主题标签中标注为“Other”，未归入更具体的主题类别，这可能对按主题检索的用户造成一定限制。项目名称虽然提示了研究方向，但项目内部实际包含的数据类型与规模，源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、许可协议、使用条款或授权要求。用户如需引用或使用该项目的数据，应前往 NCBI BioProject 对应记录页面，查看是否有相关的引用说明或使用政策。关于数据再分发、商业使用或修改权限等具体许可信息，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE322553

访问原始数据

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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1430408

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

三级淋巴结构（TLS）与免疫治疗的有利应答相关，但其在肿瘤中形成和维持的机制仍不明确。通过对人类肿瘤进行高分辨率空间映射，我们发现在TLS内CCR7⁺成熟树突状细胞（DC）的一致性积聚。为剖析其功能，我们开发了一种非小细胞肺癌（NSCLC）模型，该模型可重现成熟TLS的形成。利用该模型，我们证明TLS的诱导需要IFNγ驱动的1型经典树突状细胞（cDC1）成熟、其向肿瘤引流淋巴结（tdLN）的迁移，以及随后tdLN致敏T细胞向肿瘤微环境的募集。随着肿瘤进展，即使缺乏tdLN T细胞流出，TLS仍持续存在，同时伴有cDC1向tdLN迁移受损及其滞留于富含CCR7配体的瘤内基质枢纽中。定时清除cDC1或阻断其向这些枢纽的定位会破坏TLS的维持。

值得注意的是，cDC1上MHC I类和II类的同步基因消融会消除TLS的维持、滤泡辅助性T（TFH）细胞、生发中心形成、肿瘤特异性IgG产生以及祖细胞耗竭CD8⁺ T细胞的分化。这些发现确立了局部cDC1介导的向CD8⁺和CD4⁺ T细胞的抗原呈递是抗肿瘤TLS程序的核心协调者，也是治疗干预的有力靶点。总体设计：人类结直肠癌（CRC；n = 4）、肝癌（HCC；n = 1）和肺癌（NSCLC；n = 2）的Visium空间转录组学

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别