基本信息

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基因组

任务类型

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1425050：细胞毒性CD39+肿瘤相关NK细胞响应NKG2A阻断（肺癌，10x Xenium）

该数据集在 NCBI BioProject 中的编号为 1425050，英文名称为“Cytotoxic CD39+ tumor-associated NK cells respond to NKG2A blockade in lung cancer (10x Xenium)”。从名称可以看出，该数据集围绕肺癌中细胞毒性 CD39+ 肿瘤相关自然杀伤（NK）细胞对 NKG2A 阻断的响应这一主题展开，并采用 10x Xenium 技术。本站将其归类为肿瘤 / 肺癌方向。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，属于 BioProject 类型的生物学数据集合。BioProject 通常围绕某一项研究计划，汇集由单一机构或联合体产生的多种类型生物学数据，并为用户提供统一入口，以便查找与该项目相关的各类数据资源。该数据集的主题标签为“Other”。

【数据集背景】

该数据集所对应的研究主题聚焦于肺癌微环境中的 NK 细胞。具体而言，其关注的是细胞毒性 CD39+ 肿瘤相关 NK 细胞，以及这类细胞对 NKG2A 阻断的响应。NK 细胞是免疫系统中具有细胞毒性功能的淋巴细胞，在肿瘤免疫监视中发挥重要作用；肿瘤相关 NK 细胞则指存在于肿瘤微环境中的 NK 细胞群体。CD39 是一种细胞表面标志物，本数据集所涉及的对象为 CD39 阳性的肿瘤相关 NK 细胞。NKG2A 是一种抑制性受体，阻断 NKG2A 可能影响 NK 细胞的杀伤活性。该数据集即围绕这一生物学问题，采用 10x Xenium 技术开展相关数据采集。该数据集来自 NCBI BioProject，编号为 1425050。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Other”。其英文名称中明确标注了“10x Xenium”，表明该数据集采用了 10x Xenium 技术。该技术通常用于空间转录组学分析，可在组织切片中实现基因表达的原位检测与空间定位。结合数据集名称可知，其数据内容应与肺癌组织中细胞毒性 CD39+ 肿瘤相关 NK 细胞对 NKG2A 阻断响应的空间分子特征相关。除上述信息外，源站未提供关于数据具体组成、文件类型、样本数量、基因 panel 或数据规模的进一步说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，BioProject 编号为 1425050。BioProject 是围绕单一研究计划或联合体计划组织生物学数据的集合，其记录为用户提供查找该项目所产生多种数据类型链接的统一入口。该数据集在本站被归类为肿瘤 / 肺癌。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体实验流程以及项目所属机构等细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与肺癌免疫微环境相关的研究场景，尤其是涉及肿瘤相关 NK 细胞、CD39 阳性细胞群体、NKG2A 阻断响应以及空间转录组分析的研究方向。由于采用了 10x Xenium 技术，该数据集可能适合用于探索肺癌组织切片中特定细胞类型的空间分布与基因表达特征。此外，该数据集也可作为 BioProject 资源，用于检索与该研究计划相关的其他类型数据。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物开发或特定分析流程，源站未提供明确说明。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 获取，编号为 1425050。用户可在 BioProject 记录中查找与该项目相关的数据链接。由于该数据集标注了 10x Xenium，使用时应参考 10x Xenium 相关数据处理流程进行空间转录组分析。关于具体的下载方式、文件格式、分析工具、参数设置以及是否需要申请权限等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject，属于公共生物学数据资源。其主题标签为“Other”。关于数据质量评估指标、测序深度、细胞捕获效率、空间分辨率、批次效应、样本代表性以及潜在偏差等信息，源站未提供。该数据集名称中虽提及 NKG2A 阻断响应，但源站未提供具体实验设计、对照设置或统计分析方法，因此无法对结论强度作出判断。使用者在解释结果时应注意这些限制。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI BioProject，编号为 1425050，源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许再分发或商业使用等信息，源站未提供。建议用户在使用前查阅 NCBI BioProject 页面及相关数据记录，以获取最新的引用与许可要求。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319755

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1425050

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

自然杀伤（NK）细胞靶向免疫疗法正在兴起，但肿瘤浸润NK细胞的分化及功能状态仍知之甚少。我们利用非小细胞肺癌（NSCLC）患者样本的配对单核RNA和ATAC测序，解析了肿瘤内NK细胞的转录和表观遗传景观。我们鉴定出两个肿瘤相关NK（taNK）细胞亚群，分别以ITGAE（CD103）和ITGA1（CD49a）表达为标志，它们表现出组织驻留和功能障碍的特征，同时保留细胞毒性功能。轨迹和调控子分析揭示了一种炎症驱动的转变，从早期颗粒酶K（GZMK）+ NK细胞向以干扰素刺激基因（ISG）程序为特征的ENTPD1+（CD39+）效应状态过渡。功能分析确定CD39+ taNK细胞是主要的细胞毒性NK细胞群体，具有优越的杀伤能力，且该能力可被NKG2A阻断进一步增强。本研究为NSCLC中NK细胞分化提供了机制性见解，并确立CD39+ taNK细胞作为免疫治疗的可靶向效应群体。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别