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时间序列

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1420747：血管STING激活促进小细胞肺癌NK细胞抗肿瘤免疫[空间转录组]

PRJNA1420747 是一个来源于 NCBI BioProject 数据库的生物项目记录，其完整英文名称为“Vascular STING activation facilitates NK cell anti-tumor immunity in small cell lung cancer [Spatial_Transcriptome]”。从名称可以看出，该项目聚焦于小细胞肺癌研究领域，核心科学问题围绕血管 STING 激活如何促进 NK 细胞抗肿瘤免疫这一机制展开，并明确标注了空间转录组（Spatial_Transcriptome）这一数据维度。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 肺癌方向，主题标签为 Other。整体而言，该数据集可用于探索小细胞肺癌肿瘤微环境中血管 STING 通路与 NK 细胞免疫应答之间的空间关系及相关机制，为相关基础与转化研究提供数据支撑。

【数据集背景】

该数据集所对应的研究主题为血管 STING 激活促进小细胞肺癌中 NK 细胞抗肿瘤免疫。小细胞肺癌是肺癌中具有高度侵袭性的亚型，其肿瘤微环境中的免疫调控机制是当前研究关注的方向之一。STING 通路作为天然免疫应答中的重要信号通路，其在血管内皮中的激活与 NK 细胞抗肿瘤免疫之间的联系，构成了该项目的核心研究内容。项目名称中标注的“Spatial_Transcriptome”表明该研究采用了空间转录组技术路线，用以在空间维度上解析上述免疫机制。该记录来源于 NCBI BioProject，属于单一研究计划下汇聚多种数据类型的数据集合。

【数据内容】

该数据集为 BioProject 记录，其英文名称中明确包含空间转录组（Spatial_Transcriptome）标识，说明该项目包含空间转录组相关的生物学数据。BioProject 记录的作用在于为用户提供一个统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。关于该数据集具体包含的样本数量、测序平台、数据文件格式、基因表达矩阵或空间坐标信息等细节，源站未提供。主题标签为 Other，本站分类为肿瘤 / 肺癌。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心（NCBI）的 BioProject 数据库。源站描述指出，BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一组织或联盟的生物学数据集合，其记录为用户提供查找该项目所生成多种数据类型的统一位置。该项目的 BioProject ID 为 1420747。关于样本采集的具体地点、时间、人群特征、实验处理流程及测序策略等信息，源站未提供。

【适用场景】

依据其研究主题，该数据集可用于探索小细胞肺癌肿瘤微环境中血管 STING 通路与 NK 细胞免疫应答的空间关系及相关机制研究。空间转录组数据的特性使其适用于在组织空间背景下考察基因表达分布，从而辅助理解血管 STING 激活与 NK 细胞抗肿瘤免疫之间的空间关联。此外，该数据集也可作为肿瘤免疫、肺癌微环境及 STING 通路相关研究的参考数据资源。关于其他具体应用场景，源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 BioProject 记录的形式提供，用户可通过 NCBI BioProject 数据库以项目 ID 1420747 进行检索与访问，并借助该记录查找该项目关联的多种数据类型。关于数据下载方式、分析流程、软件工具及参数设置等具体使用方法，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公开的生物学数据项目记录。关于数据质量评估指标、样本量、测序深度、数据完整性及潜在偏差等信息，源站未提供。使用者在将该数据集应用于具体研究时，应结合源站记录自行核实相关技术细节。该数据集的适用性受其研究主题与空间转录组数据类型的限定，是否适用于其他研究问题需另行评估。

【引用与许可】

该数据集来源于 NCBI BioProject，项目 ID 为 1420747，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的具体引用格式、许可条款及使用限制等信息，源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时，应遵循 NCBI 及 BioProject 数据库的相关规定，并查阅源站记录以获取最新的引用与许可信息。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318867

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1420747

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

小细胞肺癌（SCLC）通常呈现“冷”肿瘤微环境，免疫浸润稀少。神经内分泌型SCLC细胞还会强烈抑制MHC-I表达，使其易受NK细胞介导的细胞毒性攻击。在此，我们证实神经内分泌型SCLC细胞对NK细胞介导的攻击敏感，然而对患者样本中SCLC免疫微环境的定量空间分析显示，效应免疫细胞（包括NK细胞）被排除在MHC-Ilow/neg的SCLC区域之外。为研究这一生物学现象，我们开发了微生理免疫肿瘤环境的动态单细胞RNA测序技术（DynaMITE-seq），并将结果与患者组织的空间转录组学整合，揭示微血管是限制NK细胞外渗/募集的主要检查点。我们证明，激活血管干扰素基因刺激因子（STING）信号可恢复NK细胞对神经内分泌型SCLC的浸润和杀伤，提示这是一种克服SCLC关键免疫屏障并为DLL3靶向CAR-NK细胞疗法的治疗应答做好铺垫的策略。

总体设计：来自FFPE组织的SCLC患者样本的空间转录组学（Visium平台）

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别