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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1406704：多组学分析揭示微环境重塑是屋尘螨诱导肺癌进展的关键驱动因素

PRJNA1406704 是 NCBI BioProject 收录的一个生物项目，其英文标题为“Multi-omics profiling reveals microenvironmental remodeling as a key driver of house dust mite-induced lung cancer progression”。从标题可以看出，该项目围绕多组学分析展开，旨在探讨微环境重塑在屋尘螨诱导的肺癌进展过程中所起的关键驱动作用。本站将该数据集归类于肿瘤 / 肺癌方向，并为其标注了 Epigenomics 主题标签。该项目的源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题显示为“Multi-omics profiling reveals microenvironmental r... (ID 1406704) - BioProject - NCBI”。整体而言，这是一个以多组学手段研究屋尘螨暴露与肺癌进展关系的生物项目记录，适合关注肺癌微环境、表观基因组学以及多组学整合分析的研究人员参考。

【数据集背景】

该数据集对应的项目聚焦于屋尘螨诱导的肺癌进展机制。根据项目标题，研究核心在于通过多组学分析揭示微环境重塑是这一进展过程的关键驱动因素。屋尘螨作为一种常见环境暴露因素，其与肺癌进展之间的关联是该项目的切入点。项目被本站归入肿瘤 / 肺癌分类，并带有 Epigenomics 主题标签，说明其研究内容涉及表观基因组学层面的数据与分析。源站为 NCBI BioProject，该平台用于汇集与单一研究计划相关的多种生物数据，便于用户从一个入口找到该项目产生的不同数据类型。

【数据内容】

该数据集为 NCBI BioProject 收录的 PRJNA1406704 项目。项目标题表明其涉及多组学分析，并围绕微环境重塑与屋尘螨诱导肺癌进展的关系展开。主题标签为 Epigenomics，提示项目中包含表观基因组学相关数据。关于具体的数据类型、样本数量、组学层次、文件格式与数据规模，源站未提供。

【采集与来源】

该项目的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Multi-omics profiling reveals microenvironmental r... (ID 1406704) - BioProject - NCBI”。源站描述指出，BioProject 是汇集与单一研究计划相关的生物数据的集合，这些数据来自单一组织或联盟；BioProject 记录为用户提供一个统一入口，以查找为该项目生成的多种数据类型。关于样本采集地点、采集时间、物种、组织类型、实验设计等具体信息，源站未提供。

【适用场景】

基于项目标题与主题标签，该数据集适用于与肺癌微环境、屋尘螨诱导的肺癌进展、多组学整合分析以及表观基因组学相关的研究场景。研究人员可将其用于探索微环境重塑在肿瘤进展中的作用，或作为多组学数据整合分析的参考项目。关于更具体的适用场景，如特定分析流程、疾病模型或临床转化方向，源站未提供。

【使用方法】

该数据集为 NCBI BioProject 记录，用户可通过源站提供的统一入口查找为该项目生成的多种数据类型。关于具体的数据下载方式、访问链接、分析工具、预处理步骤或使用协议，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject，属于生物项目记录。关于数据质量指标、覆盖度、批次效应、样本代表性、技术偏差或验证情况，源站未提供。使用时应结合源站记录自行评估数据适用性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制或相关发表物信息，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE317298

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1406704

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

长期暴露于常见气传过敏原屋尘螨（HDM）可诱导肺部炎症和DNA损伤，但其对肺癌发生发展的影响在很大程度上仍未被探索。我们利用全基因组测序、RNA测序和DNA甲基化谱分析，评估了HDM对肺上皮细胞系和小鼠原位肺癌模型的影响。HDM加速了肿瘤生长，但未改变突变负荷。转录组和表观遗传分析揭示了组织特异性效应：在正常肺组织中，HDM增强了促炎和免疫激活程序，而在肿瘤中则抑制了T细胞反应、抗原呈递和趋化因子信号传导。免疫解卷积显示向髓系富集和淋系抑制的转变，细胞毒性T细胞和NK细胞特征减少。值得注意的是，HDM驱动的肿瘤促进作用在Il17a−/−小鼠中被消除，但在Il1b−/−小鼠中未被消除，表明IL-17A是关键介质。这些发现表明，长期气传过敏原暴露重塑肺部微环境，促进免疫抑制并加速肺癌进展。

总体设计：慢性HDM暴露后小鼠肺部肿瘤及匹配的邻近正常组织的甲基化谱分析

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别