PRJNA1378935：CREBBP缺失通过沉默STING和MHC I表达促进小细胞肺癌免疫逃逸 [ChIP-Seq]

资源简介

PRJNA1378935：CREBBP缺失通过沉默STING和MHC I表达促进小细胞肺癌免疫逃逸 [ChIP-Seq]

该数据集来自 NCBI，属于肿瘤/肺癌分类下的表观基因组学数据，聚焦小细胞肺癌（SCLC）中 CREBBP 缺失导致的免疫逃逸机制。大多数小细胞肺癌患者对免疫治疗表现出原发性耐药，但其分子机制尚不清楚。该数据集对应的研究通过 Rb1/Trp53 驱动的小鼠模型，发现 SCLC 中常见的 CREBBP 缺失会诱导免疫“冷”肿瘤微环境；机制上，Crebbp 缺失通过降低 H3K27 和 H3K18 乙酰化，在表观遗传层面抑制 STING 与 MHC I 的表达。该数据以 ChIP-Seq 为技术手段，为研究表观遗传调控与肿瘤免疫逃逸之间的关系提供了数据基础。

【数据集背景】

小细胞肺癌（SCLC）是一种对免疫治疗普遍存在原发性耐药的肿瘤类型，多数患者难以从免疫治疗中获益，而其耐药背后的分子机制长期缺乏清晰解释。CREBBP 是 SCLC 中频繁发生改变的基因之一。相关研究在 Rb1/Trp53 驱动的小鼠模型中观察到，CREBBP 缺失会促使肿瘤形成免疫“冷”微环境，即不利于免疫细胞浸润与激活的状态。机制研究表明，Crebbp 缺失通过降低 H3K27 与 H3K18 的乙酰化水平，在表观遗传层面抑制 Sting 和 MHC I 的表达，从而削弱肿瘤的免疫可见性。该数据集正是围绕这一机制产生的 ChIP-Seq 数据，主题标签为表观基因组学，服务于 SCLC 免疫逃逸的表观遗传机制研究。

【数据内容】

该数据集为 ChIP-Seq 数据，属于表观基因组学范畴，用于检测与组蛋白乙酰化修饰相关的染色质结合特征。结合研究背景，其数据内容与 H3K27 和 H3K18 乙酰化水平的分析相关，用以支撑 Crebbp 缺失后 Sting 与 MHC I 表达受表观遗传抑制的结论。关于样本数量、测序深度、数据文件类型与具体基因组坐标等细节，源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），数据集英文名称为 PRJNA1378935: CREBBP Loss Promotes Immune Evasion by Silencing STING and MHC I Expression in Small Cell Lung Cancer [ChIP-Seq]。研究基于 Rb1/Trp53 驱动的小鼠模型开展。关于具体样本采集流程、实验批次与测序平台等信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤表观遗传学与肿瘤免疫学交叉方向的研究，尤其是小细胞肺癌免疫逃逸机制的分析。可用于考察 CREBBP 缺失背景下组蛋白乙酰化修饰（H3K27、H3K18）与 STING、MHC I 表达调控之间的关系，也可作为表观基因组学数据整合分析、免疫“冷”肿瘤微环境相关机制研究的参考数据。关于其在临床转化或药物靶点筛选中的具体应用，源站未提供。

【使用方法】

该数据集为 ChIP-Seq 数据，常规使用方式包括对测序读段进行比对、峰 calling 与注释，以及围绕 H3K27 与 H3K18 乙酰化信号进行比较分析，从而评估 Crebbp 缺失对相关基因位点表观修饰的影响。关于数据的具体处理流程、参考基因组版本与分析参数，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于 Rb1/Trp53 驱动的小鼠模型，其结论向人类 SCLC 的外推需谨慎。关于数据质量指标（如测序深度、重复性、峰富集程度等）以及样本量与批次信息，源站未提供。使用时应结合源站原始记录核实数据完整性与适用范围。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与使用许可条款，源站未提供。使用前应访问 NCBI 对应数据集页面，查阅原始发布信息与相关条款。