PRJNA1375549：ASCL1 C端磷酸化降解子调控小细胞肺癌中ASCL1蛋白稳定性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1375549

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

ASCL1是小细胞肺癌（SCLC）和其他高级别神经内分泌肿瘤中一种谱系转录因子依赖性因子，但一直无法成靶。为揭示调控ASCL1丰度的机制，我们将全基因组CRISPR敲除和碱基编辑平铺筛选与内源性ASCL1报告系统、定量蛋白质组学和结构建模相结合。我们鉴定出HUWE1是SCLC中ASCL1的主要E3连接酶，并确定了一个以Ser207和末端Trp/Phe残基为中心的保守C端磷酸降解子，该降解子为HUWE1结合和ASCL1蛋白降解所必需。破坏该降解子可阻止HUWE1结合并使ASCL1过度稳定，将其锁定在染色质上，并矛盾性地损害SCLC增殖。这些发现揭示了HUWE1中一个更具普遍性的磷酸降解子识别模块，可作为ASCL1蛋白降解的可靶向调控开关。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。