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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJEB86523：肺癌细胞中KRAS抑制耐药遗传机制的功能基因组筛选

该数据集在 NCBI BioProject 中的编号为 PRJEB86523，英文名称为“Functional genomic screens investigating genetic mechanisms of resistance to KRAS inhibition in lung cancer cells”，中文可理解为“通过功能基因组筛选研究肺癌细胞对 KRAS 抑制产生耐药的遗传机制”。从分类上看，它归属于肿瘤 / 肺癌方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。其核心主题是围绕肺癌细胞在受到 KRAS 抑制后如何产生耐药这一关键问题，借助功能基因组筛选手段寻找可能涉及的遗传机制。对于关注 KRAS 靶向治疗耐药机制、肺癌功能基因组学以及相关转化研究的人员而言，该数据集提供了一个可追溯至 NCBI BioProject 的项目入口，便于进一步定位和获取由该项目产生的多种类型生物学数据。

【数据集背景】

KRAS 是肺癌中常见的驱动基因之一，针对 KRAS 的抑制策略在肿瘤治疗研究中受到持续关注。然而，肿瘤细胞往往会对 KRAS 抑制产生耐药，导致治疗效果受限。理解耐药产生的遗传机制，对于优化治疗策略、寻找联合干预靶点具有重要意义。该数据集所对应的 BioProject 项目，正是以肺癌细胞为研究对象，通过功能基因组筛选来探索与 KRAS 抑制耐药相关的遗传机制。其主题标签为“Other”，表明在既有的分类体系中并未归入某个更具体的标签类别。该项目的英文标题明确指向“功能基因组筛选”和“KRAS 抑制耐药”，说明其研究重心在于从全基因组或大规模功能筛选层面发现耐药相关基因或遗传事件。

【数据内容】

该数据集来自 NCBI BioProject，编号为 PRJEB86523。BioProject 本身是一个与单一研究计划相关的生物学数据集合，通常由单一机构或联盟发起，并为用户提供一个统一入口，以查找该项目所产生的多种数据类型。因此，该数据集的内容并不局限于某一种特定实验测定结果，而是围绕“肺癌细胞对 KRAS 抑制产生耐药的遗传机制”这一研究目标，汇集与之相关的生物学数据。源站描述指出，BioProject 记录使用户能够在一个位置找到该项目生成的不同数据类型之间的链接。至于该项目具体包含哪些样本、采用何种筛选文库、产生哪些测序或筛选结果，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，记录类型为 BioProject，编号 PRJEB86523。源站标题显示为“Functional genomic screens investigating genetic m... (ID 1447342) - BioProject - NCBI”，其中 ID 1447342 为该 BioProject 在 NCBI 中的记录标识。项目英文名称进一步说明其研究内容为在肺癌细胞中开展功能基因组筛选，以研究 KRAS 抑制耐药的遗传机制。关于样本采集地点、采集时间、细胞系来源、实验操作流程、筛选方法细节以及数据生成平台等信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与肺癌 KRAS 抑制耐药机制相关的研究场景。例如，研究人员可以将其作为项目入口，查找由该 BioProject 关联的多种数据类型，进而用于探索耐药相关遗传机制、开展功能基因组筛选结果的整合分析，或为后续实验设计提供线索。由于该数据集分类为肿瘤 / 肺癌，它也可能对肿瘤生物学、靶向治疗耐药研究以及功能基因组学方法学应用等方向具有参考价值。但具体适用性仍需结合项目实际产生的数据内容来判断，源站未提供更细化的适用说明。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 平台访问，编号为 PRJEB86523。用户可在 BioProject 记录中查找与该项目相关的不同数据类型链接。源站描述强调，BioProject 记录为用户提供一个单一位置，以便找到为该项目生成的多样数据类型。关于如何下载、如何分析、是否需要特定工具或流程等操作细节，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公共数据库中的项目记录。其质量与限制取决于项目本身的数据提交情况以及 NCBI BioProject 的记录规范。源站描述仅说明 BioProject 是相关生物学数据的集合，并提供多数据类型链接，未对该数据集的具体质量指标、完整性、准确性或使用限制做出说明。因此，关于数据质量、样本量、实验重复、数据覆盖度以及潜在偏差等信息，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集对应的 BioProject 编号为 PRJEB86523，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制或授权要求，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJEB86523

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB86523

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

与在KRAS抑制剂存在下肺癌细胞功能基因组学筛选相关的测序数据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别