非吸烟者非小细胞肺癌基因组图谱:全外显子测序
该数据集来自 NCBI BioProject(编号 PRJEB31946),聚焦非吸烟者非小细胞肺癌的基因组图谱,采用全外显子测序技术

基本信息
资源简介
非吸烟者非小细胞肺癌基因组图谱:全外显子测序
PRJEB31946 是一个聚焦于非吸烟者非小细胞肺癌基因组图谱的全外显子测序数据集,来源于 NCBI BioProject 数据库,编号为 PRJEB31946。该数据集围绕非吸烟人群中非小细胞肺癌的发生与基因组变异特征展开,采用全外显子测序技术获取相关数据。BioProject 作为生物数据的集合记录,旨在将同一项目产生的多种数据类型汇聚于一处,便于用户集中查找与访问。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 肺癌领域,主题标签为 Other,其核心价值在于为研究非吸烟者非小细胞肺癌的基因组特征提供测序数据基础。
【数据集背景】
非小细胞肺癌是肺癌的主要类型之一,通常与吸烟行为密切相关,但在非吸烟人群中同样存在发病情况。针对这一特定人群的基因组研究,有助于理解不依赖吸烟因素驱动的肺癌分子机制。该数据集以非吸烟者非小细胞肺癌为研究对象,通过全外显子测序手段,尝试描绘其基因组图谱。源站标题显示为“The genomic landscape of non-small cell lung carcinoma in never smokers: whole-exome sequencing”,明确指出了研究人群、疾病类型与测序策略。该数据以 BioProject 形式组织,编号 PRJEB31946,属于 NCBI 管理的生物项目记录之一。
【数据内容】
该数据集的核心内容为非吸烟者非小细胞肺癌的全外显子测序数据。全外显子测序针对基因组中的蛋白编码区域进行捕获与测序,可用于识别外显子区域的变异信息。数据集聚焦于非小细胞肺癌这一疾病类型,并以非吸烟者作为特定人群限定。源站描述指出,BioProject 记录为用户提供单一入口,以查找该项目产生的多种数据类型。关于具体样本数量、测序深度、变异位点数目、覆盖度等详细指标,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 数据库中的一项记录,项目编号为 PRJEB31946。BioProject 的定位是汇集与单一研究计划相关的生物数据,这些数据可来自单一组织或联合体。该记录本身并不直接展示所有原始数据文件,而是提供指向该项目所生成的不同数据类型的链接入口。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体研究机构等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于非吸烟者非小细胞肺癌相关的基因组学研究场景。例如,可用于探索非吸烟人群中非小细胞肺癌的外显子区域变异特征,或作为比较分析中非吸烟者肺癌病例的测序数据来源。全外显子测序数据通常可用于变异筛查、突变负荷分析、候选基因识别等研究方向。此外,该数据也可用于方法学验证或作为公共数据资源进行二次分析。关于该数据集是否适用于特定分析流程或特定变异类型,源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库,以项目编号 PRJEB31946 进行检索,访问该项目的记录页面。BioProject 记录提供指向该项目所生成的不同数据类型的链接,用户可据此进一步获取相关数据。由于该记录为项目层级入口,具体数据下载方式、文件格式、分析工具等,源站未提供。用户在使用时应结合 BioProject 页面所提供的链接与说明进行操作。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公共数据库中的项目记录。BioProject 作为数据集合入口,其本身不直接等同于经过统一质控的最终分析结果。关于该数据集的数据质量评估、质控标准、批次效应、样本排除标准等,源站未提供。此外,该数据集聚焦于非吸烟者非小细胞肺癌,其结论或数据特征不宜直接外推至吸烟相关肺癌或其他人群。关于数据的具体限制与适用范围,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI BioProject,编号为 PRJEB31946。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、是否允许再分发或商业使用等,源站未提供。用户在使用该数据时,应参考 NCBI BioProject 页面及相关数据记录中可能附带的引用与许可说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB31946
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含一组非小细胞肺癌患者的外显子组测序数据。所有这些患者均无吸烟史或吸烟史极为有限。
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