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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJEB20814：呼吸系统疾病唾液代谢组学与微生物组学临床研究

该数据集为 NCBI BioProject 收录的一项生物项目，编号 PRJEB20814，英文标题为“Clinical study of saliva metabolomics and microbiomics in respiratory diseases”，中文可译为“呼吸系统疾病唾液代谢组学与微生物组学的临床研究”。其源站记录标题为“16SAmpliconSeqSaliva (ID 478733) - BioProject - NCBI”，表明该记录与唾液样本的 16S 扩增子测序相关。本站将其归类于肿瘤 / 肺癌方向，主题标签为“Other”。BioProject 作为生物数据的集合，通常围绕单一研究计划组织，来源于单一机构或联合体，并为用户提供查找该项目所产生多种数据类型链接的统一入口。该数据集即通过 NCBI BioProject 平台对外呈现，便于研究者定位与呼吸系统疾病唾液代谢组学及微生物组学相关的数据资源。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 PRJEB20814。其英文标题明确指出这是一项关于呼吸系统疾病唾液代谢组学与微生物组学的临床研究。源站记录标题为“16SAmpliconSeqSaliva (ID 478733) - BioProject - NCBI”，说明该 BioProject 记录与唾液样本的 16S 扩增子测序数据存在关联。BioProject 的设计目标是将与单一研究计划相关的生物数据集中呈现，这些数据可能来自一个机构或一个联合体，并为用户提供访问不同数据类型的统一入口。本站将该数据集分类为肿瘤 / 肺癌，主题标签为“Other”。上述信息构成了该数据集在公共数据库中的基本定位与背景框架。

【数据内容】

根据源站标题“16SAmpliconSeqSaliva (ID 478733) - BioProject - NCBI”，该数据集涉及唾液样本的 16S 扩增子测序。项目英文标题同时提及唾液代谢组学与微生物组学，表明其数据内容围绕呼吸系统疾病背景下的唾液代谢组与微生物组展开。BioProject 记录本身并不直接等同于某一类具体数据文件，而是作为项目集合，提供指向该项目所产生的多种数据类型的链接。关于具体样本数量、测序平台、代谢物种类、微生物分类单元、数据文件格式及数据量等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 NCBI BioProject，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。项目编号为 PRJEB20814，源站记录标题为“16SAmpliconSeqSaliva (ID 478733) - BioProject - NCBI”。BioProject 记录通常来源于单一组织或联合体，用于汇集与某一研究计划相关的生物数据。该项目的英文标题表明其属于临床研究，聚焦呼吸系统疾病中的唾液代谢组学与微生物组学。关于样本采集地点、采集时间、受试者人群特征、伦理审批信息及具体研究机构等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于呼吸系统疾病相关研究中对唾液微生物组与代谢组数据的检索与再利用。由于本站将其归类于肿瘤 / 肺癌方向，可能适用于肺癌或肿瘤相关呼吸系统疾病的探索性研究。16S 扩增子测序数据常用于微生物群落组成与多样性分析，代谢组学数据则可用于小分子代谢物谱分析。BioProject 作为统一入口，便于研究者发现并链接该项目产生的多种数据类型。关于该数据集是否已用于特定疾病标志物发现、诊断模型构建或治疗靶点研究等具体应用，源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过 NCBI BioProject 平台，以项目编号 PRJEB20814 或源站记录标题“16SAmpliconSeqSaliva (ID 478733) - BioProject - NCBI”进行检索，进而访问该 BioProject 记录。BioProject 记录提供指向该项目所产生不同数据类型的链接，用户可据此定位相关数据资源。关于具体的数据下载方式、分析流程、软件工具、参数设置及数据格式转换方法等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject，属于公共生物数据项目记录。BioProject 作为数据集合入口，其本身不直接提供对数据质量的评价。关于该项目的样本质量、测序深度、代谢物鉴定置信度、微生物分类准确性、数据完整性及潜在批次效应等质量相关信息，源站未提供。此外，该数据集在本站被归类为肿瘤 / 肺癌，主题标签为“Other”，但源站未提供该分类所依据的具体标准或验证信息。使用者在再利用时需自行评估数据适用性与局限性。

【引用与许可】

该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 PRJEB20814，源站记录标题为“16SAmpliconSeqSaliva (ID 478733) - BioProject - NCBI”。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款及数据共享政策等，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时，应直接访问 NCBI BioProject 对应记录以获取最新的引用与许可信息。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJEB20814

访问原始数据

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB20814

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性与急性呼吸系统疾病是临床医生面临的重大挑战，其发病率在全球范围内持续上升。开发能够准确、快速诊断呼吸系统疾病类型和分期的方法至关重要。许多方法正聚焦于以血清或痰液等作为筛查方案的基础。人类唾液中的许多生物分子来源于循环系统，因此，唾液为多种疾病提供了一种非侵入性的诊断工具。在本研究中，我们评估了唾液在揭示关键变化方面能够发挥多大作用。特别是，我们采用了代谢组学方法——该方法能够在几分钟内准确量化样本中的化学成分（数千种生化物质）——对93份唾液样本进行了评估。唾液此前也曾作为一种生物流体用于代谢组学，以识别特定的口腔癌、乳腺癌和胰腺癌特征。采样人群包括来自Hywel Dda卫生局辖区Prince Phillip医院、Gwangli医院和Bronglais医院的53名COPD患者。

这些样本包括38名年龄匹配的志愿者对照组、8名肺癌患者和18名患有多种呼吸系统疾病的患者。样本由50微升唾液组成，采用代谢组学方法进行分析，涉及使用电喷雾电离质谱（FIE-MS）技术，生成了一个包含169个样本×6500种代谢物的大型数据集。应用“多变量”统计方法能够识别出在特定样本类别中存在差异的代谢物。通过使用主成分分析（PCA）等统计方法，我们证明唾液能够区分每个临床分类的样本与对照组。这些结果通过交叉验证的受试者工作特征（ROC）曲线得到验证，其诊断准确率大于0.70。作为样本集之间变异来源的个别化学物质已被识别。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别