基本信息

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其他

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJEB107891：CD45⁺免疫景观差异塑造肺癌微环境

PRJEB107891 是一个收录于 NCBI BioProject 的生物学项目数据集，其英文名称为“Divergent CD45⁺ immune landscapes shape the lung tumor microenvironment”，中文可理解为“差异化的 CD45⁺免疫景观塑造肺部肿瘤微环境”。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 肺癌方向，主题标签为 Other。从项目名称可以看出，其研究核心围绕 CD45⁺免疫细胞在肺部肿瘤微环境中的分布差异及其潜在影响展开，属于肿瘤免疫微环境研究范畴。BioProject 作为生物数据的集合性记录，旨在将同一项研究计划所产生的多种数据类型汇聚于一处，便于用户集中查找与访问。该数据集即通过 BioProject 平台对外呈现，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级数据组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的各类生物学数据。根据源站描述，一个 BioProject 记录通常源自单一机构或联盟，并为用户提供一个统一入口，以发现该项目所生成的不同数据类型。PRJEB107891 正是这样一个项目记录，其标题指向 CD45⁺免疫景观与肺部肿瘤微环境之间的关系。该数据集被归入肿瘤 / 肺癌分类，说明其研究背景与肺癌的免疫微环境相关。CD45 是免疫细胞的常见标志物，CD45⁺细胞涵盖多种免疫细胞类型，因此该项目名称中的“Divergent CD45⁺ immune landscapes”提示研究可能关注不同样本或条件下免疫细胞组成的差异。不过，关于该项目的具体研究机构、联盟背景、立项动机等更详细的信息，源站未提供。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Other，源站未提供更细化的数据类型标签。从项目名称来看，其内容应与 CD45⁺免疫景观以及肺部肿瘤微环境相关，可能涉及免疫细胞组成、肿瘤微环境特征等方面的数据。然而，关于该数据集具体包含哪些数据文件、数据格式、样本数量、测序平台、分析方法或结果指标，源站未提供。因此，无法确认其数据内容的具体构成，也无法描述其数据量或数据组织方式。用户若需了解详细的数据内容，应直接访问 NCBI BioProject 中 PRJEB107891 的记录页面。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 收录的项目。源站描述指出，BioProject 记录来自单一机构或联盟，并提供指向该项目所生成的不同数据类型的链接。关于 PRJEB107891 的具体采集地点、样本来源、采集时间、伦理审批信息或项目承担单位，源站未提供。该数据集在分类上属于肿瘤 / 肺癌，主题标签为 Other，这些信息可作为来源背景的参考，但不足以说明其样本采集与数据生成的具体过程。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集适用于与肺部肿瘤微环境、CD45⁺免疫细胞景观相关的研究场景。例如，研究者可能利用该项目的数据探索免疫细胞在肺癌微环境中的分布差异，或将其作为肿瘤免疫相关分析的参考数据。由于该数据集被归入肿瘤 / 肺癌方向，其潜在应用场景包括肺癌免疫微环境研究、免疫细胞标志物分析等。但需要说明的是，源站未提供该数据集的具体数据类型和分析目标，因此上述适用场景仅为基于项目名称和分类的概括性描述，不代表该数据集已被验证可用于特定分析流程。实际适用性需结合项目页面中的详细说明进行判断。

【使用方法】

该数据集通过 NCBI BioProject 平台发布，用户可通过访问 ncbi.nlm.nih.gov 上 PRJEB107891 的项目页面获取相关信息。BioProject 记录的设计目的之一，是让用户能够从一个入口找到该项目所生成的不同数据类型。因此，使用方法通常包括：在 BioProject 页面查看项目描述，并沿页面提供的链接跳转至具体数据资源。关于该数据集是否需要特定工具、是否提供下载链接、是否附带分析流程或代码，源站未提供。用户应依据项目页面中的实际指引进行操作。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI BioProject 收录的项目记录，其来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，具备项目级数据组织的基本框架。然而，关于该数据集的数据质量、完整性、准确性、样本量、技术偏差或验证情况，源站未提供。主题标签为 Other，说明其主题分类较为宽泛，可能不便于按特定标签进行精确检索。此外，项目名称虽提示了 CD45⁺免疫景观与肺部肿瘤微环境的研究方向，但源站未提供具体结论或数据指标，因此无法对数据质量进行进一步评估。使用该数据集时，应充分注意其信息局限，并以项目页面中的原始描述为准。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或版权信息，源站未提供。用户在使用该数据集时，应查阅 NCBI BioProject 页面中可能附带的引用指南与许可说明，并遵循相关机构或数据提供方的要求。由于源站未提供具体引用格式或授权条款，无法在此给出确切的引用与许可信息。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJEB107891

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB107891

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：肺肿瘤微环境（TME）在肺癌的进展和转移中起着至关重要的作用。它由多种细胞类型组成，这些细胞以复杂的方式相互作用，影响肿瘤行为。CD45+细胞作为TME的组成部分，在肺癌中具有复杂且多方面的作用。CD45+细胞的抗肿瘤与促肿瘤功能之间的平衡可显著影响肺癌的结局。理解这些作用对于开发靶向治疗至关重要，这些治疗可利用CD45+细胞的有益效应，同时减轻其有害效应。方法：我们对来自健康肺、原位LLC1肿瘤和KrasLA2（Kras）基因工程肿瘤的分选CD45⁺免疫细胞进行了单细胞RNA测序。分析包括免疫组成、转录程序、分化轨迹、代谢状态以及基于配体-受体的细胞间通讯网络。结果：四个主要免疫区室，即B细胞、T细胞、NK细胞和巨噬细胞，发生了模型特异性重塑。LLC1肿瘤显示B细胞扩增以及T细胞和NK细胞减少，并伴有炎症、应激反应和以NF‑κB/TNF为主导的程序。

KrasLA2肿瘤保持了平衡的免疫组成，但表现出代谢重编程、抗原呈递特征升高以及选择性细胞间信号传导。亚聚类分析揭示了B细胞（静息、成熟、前Bcr、晚期原B、浆细胞）、T细胞（Cd4⁺、Cd8⁺、记忆、活化、Treg、Th17）、NK细胞（Fcgr3高表达、Fcgr3低表达、Xcl1⁺）和巨噬细胞（Ace⁺、Bcr⁺、Ccr2⁺、Cd3⁺、代谢型、MHCII⁺）亚群中的特异性变化。配体-受体分析突显了LLC1肿瘤中密集的炎症网络，而KrasLA2肿瘤中则为代谢调谐的信号传导。结论：以LLC1炎症抑制和KrasLA2代谢适应为特征的独特CD45⁺免疫景观塑造了肺肿瘤生物学。该图谱识别了基因型特异性免疫脆弱性，具有p

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别