PRJEB105384：非小细胞肺癌患者多类样本的微生物组图谱
该数据集来自一项针对接受根治性手术的非小细胞肺癌（NSCLC）患者的前瞻性观察研究，采集肿瘤、癌旁组织、血液和唾液等多部位样本
基本信息
资源简介
PRJEB105384：非小细胞肺癌患者多类样本的微生物组图谱
该数据集来自一项针对接受根治性手术的非小细胞肺癌（NSCLC）患者的前瞻性观察研究，采集肿瘤、癌旁组织、血液和唾液等多部位样本。对提取DNA进行16S rRNA基因巢式PCR扩增后在Illumina MiSeq平台测序，部分样本用QIAcuity数字PCR定量并进一步做宏基因组测序（MGS）。微生物组图谱按样本类型、重复样本及与对照的关系进行分析，所有唾液样本还进行16S rRNA基因全长测序，以考察细菌多样性和群落组成与临床特征及癌症结局的差异。数据可用于研究NSCLC相关微生物组特征及样本类型间比较（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：这是一项针对接受根治性手术的非小细胞肺癌（NSCLC）患者的前瞻性观察研究。样本采集自多个身体部位，包括肿瘤、癌旁组织、血液和唾液。提取的DNA经过16S rRNA基因的巢式PCR扩增，随后在Illumina MiSeq平台上测序。一部分样本使用QIAcuity数字PCR进行定量，并通过宏基因组测序（MGS）进一步分析。微生物组图谱按样本类型、重复样本以及与对照的关系进行分析。所有唾液样本还进行了16S rRNA基因的全长测序，并检查了细菌多样性和群落组成与临床特征及癌症结局的差异。
【主题与分类】
主题标签：Other。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB105384
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB105384
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
这是一项针对接受根治性手术的非小细胞肺癌（NSCLC）患者的观察性前瞻性研究。样本采集自多个身体部位，包括肿瘤组织、癌旁组织、血液和唾液。提取的DNA经16S rRNA基因巢式PCR扩增后，在Illumina MiSeq平台上进行测序。部分样本采用QIAcuity数字PCR进行定量，并进一步通过宏基因组测序（MGS）进行分析。微生物组图谱按样本类型、重复样本以及与对照样本的关系进行分析。所有唾液样本还进行了16S rRNA基因的全长测序，并考察了细菌多样性和群落组成与临床特征及癌症结局之间的差异。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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