PRJEB103096：氯喹处理后的非小细胞肺癌PDX组织RNA测序
该数据集为PRJEB103096，来源于NCBI，包含非小细胞肺癌（NSCLC）患者来源异种移植（PDX）组织在氯喹（CQ）处理后的RNA测序数据
基本信息
资源简介
PRJEB103096：氯喹处理后的非小细胞肺癌PDX组织RNA测序
PRJEB103096 是一个聚焦非小细胞肺癌（NSCLC）的转录组测序数据集，来源于 NCBI。该数据集围绕患者来源异种移植（PDX）组织在氯喹（CQ）处理后的基因表达变化展开，采用 RNA 测序（RNA-seq）技术，比较对照组（溶剂处理）与 CQ 处理组之间的转录组差异。其研究对象为腺癌型 NSCLC 的 PDX 模型（PDX #72-1001），旨在从转录水平探索肿瘤细胞在 CQ 介导的溶酶体抑制条件下如何存活。数据集在分类上归属于肿瘤／肺癌方向，主题标签为 Other，可为肺癌基础研究与溶酶体相关机制研究提供转录组层面的数据参考。
【数据集背景】
功能性溶酶体对肿瘤生长具有重要作用。氯喹（CQ）是一种广泛使用的溶酶体抑制剂，已被与多种其他治疗手段联合用于癌症患者的试验性研究，但此前尚无研究报道这些联合处理能够产生增强的抗肿瘤效果。为探究肿瘤细胞在 CQ 介导的溶酶体抑制下如何存活，研究者针对腺癌型 NSCLC 患者来源异种移植模型（PDX #72-1001）开展了转录组分析，通过 RNA 测序比较对照组（溶剂）与 CQ 处理组之间的基因表达变化。该数据集即产生于这一研究背景之下。
【数据内容】
该数据集为 RNA 测序数据，测序对象为非小细胞肺癌患者来源异种移植（PDX）组织，处理条件包括氯喹（CQ）处理与对照（溶剂）处理两组，用于比较两组间的基因表达变化。数据集的英文名称为“RNA sequencing of non–small cell lung cancer (NSCLC) patient-derived xenograft (PDX) tissues following chloroquine (CQ) treatment”，在分类上属于肿瘤／肺癌，主题标签为 Other。关于样本数量、测序平台、读长、数据量、文件格式等具体技术参数，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），编号为 PRJEB103096。其生物样本为非小细胞肺癌患者的 PDX 组织，具体为腺癌型 NSCLC 的 PDX #72-1001 模型，实验设置包括对照组（vehicle，溶剂处理）与 CQ 处理组。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、PDX 模型构建细节及测序服务提供方等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肺癌转录组研究，尤其是围绕溶酶体抑制与肿瘤细胞存活机制的分析场景。研究者可利用该数据比较 CQ 处理与对照条件下 PDX 组织的基因表达差异，探索肿瘤细胞在溶酶体功能受抑时的转录应答；也可作为非小细胞肺癌 PDX 模型 RNA-seq 数据的参考，用于差异表达分析、通路层面的探索性研究，或与其它肺癌转录组数据进行比较分析。关于该数据集是否适用于特定临床转化研究或药物联用评估，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI 来源站点获取，具体访问编号为 PRJEB103096。使用时可依据研究目的提取 CQ 处理组与对照组的 RNA-seq 数据，开展差异表达分析等转录组层面的比较研究。关于数据下载的具体流程、文件组织方式、预处理与质控步骤、参考基因组版本及分析流程建议，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于单一 PDX 模型（PDX #72-1001）的腺癌型 NSCLC 组织，实验比较的是 CQ 处理与溶剂对照两组。关于测序深度、数据质量评分、重复样本数量、批次效应及数据完整性等质量相关信息，源站未提供。使用时应结合具体研究问题评估其适用性；由于源站未提供样本量与技术参数，相关局限性的具体判断无法在此给出。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI，编号为 PRJEB103096。关于数据使用许可、引用方式及所需致谢的具体要求，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB103096
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
功能性溶酶体对肿瘤生长至关重要。CQ是一种广泛使用的溶酶体抑制剂，已与多种其他疗法联合用于癌症患者的试验。然而，尚无研究报道这些治疗能增强抗肿瘤效果。为探究肿瘤细胞如何在CQ介导的溶酶体抑制下存活，我们利用RNA测序（RNA-seq）对一例腺癌非小细胞肺癌（NSCLC）患者来源异种移植瘤（PDX #72-1001）进行转录组分析，以比较对照组（溶媒）与CQ治疗组之间的基因表达变化。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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