基本信息

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分类

创建/更新时间

2026-10-21

资源简介

骨转移性肺癌细胞外泌体miRNA-seq数据集

该数据集为骨转移性肺癌细胞来源外泌体的miRNA-seq数据，来源于ncbi.nlm.nih.gov，属于肿瘤/肺癌分类。研究聚焦于鉴定外泌体中富集并促进溶骨性骨转移的miRNA，通过对非转移性（NC-LLC）与骨转移性（BM-LLC）Lewis肺癌细胞培养上清液纯化外泌体直接进行miRNA测序，刻画肿瘤来源外泌体的miRNA货物组成，并寻找细胞间通讯的关键调控因子。结合受体巨噬细胞的mRNA测序数据整合分析，鉴定出外泌体miR-484是破骨细胞分化与骨转移的关键驱动因子。该数据集为肺癌骨转移机制研究、外泌体miRNA功能研究以及相关生物标志物探索提供了测序资源。

【数据集背景】

肺癌是常见恶性肿瘤之一，骨转移是其常见的远处转移部位，常导致溶骨性病变、骨痛、病理性骨折等严重并发症。肿瘤来源外泌体携带miRNA等生物活性分子，在肿瘤微环境重塑和远处转移中发挥重要介导作用。本研究旨在识别外泌体中富集并促进溶骨性骨转移的miRNA，通过比较非转移性与骨转移性Lewis肺癌细胞来源外泌体的miRNA表达谱，揭示外泌体miRNA在细胞间通讯中的调控作用，并进一步结合受体巨噬细胞的mRNA测序数据，寻找驱动破骨细胞分化和骨转移的关键分子。

【数据内容】

该数据集为miRNA-seq数据，测序对象为从细胞培养上清液中纯化的外泌体。样本来源包括非转移性（NC-LLC）和骨转移性（BM-LLC）Lewis肺癌细胞。研究直接对这些外泌体进行miRNA测序，以分析其miRNA货物组成。数据集的主题标签为Other。源站未提供样本数量、测序平台、读长、数据量、原始数据格式等具体技术参数。源站未提供miRNA表达矩阵、差异表达miRNA列表或靶基因预测结果等衍生数据信息。

【采集与来源】

数据来源于ncbi.nlm.nih.gov。样本为体外培养的Lewis肺癌细胞系来源外泌体，包括非转移性NC-LLC和骨转移性BM-LLC两组。外泌体从细胞培养上清液中纯化后直接进行miRNA测序。研究还整合了受体巨噬细胞的mRNA测序数据用于联合分析。源站未提供细胞培养条件、外泌体分离纯化方法、测序建库流程、测序平台型号及数据处理流程等详细信息。

【适用场景】

该数据集适用于肺癌骨转移机制研究，尤其是外泌体miRNA在肿瘤细胞与巨噬细胞间通讯中的作用研究；可用于探索外泌体miRNA调控破骨细胞分化的分子机制；可用于肺癌骨转移相关生物标志物的筛选与验证；也可作为外泌体miRNA测序分析的方法学参考。结合受体巨噬细胞mRNA测序数据的整合分析思路，可应用于其他肿瘤外泌体与微环境细胞互作的研究场景。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明。通常此类miRNA-seq数据可用于差异表达分析、miRNA靶基因预测、通路富集分析以及与mRNA测序数据的整合分析。使用者可根据研究目的进行外泌体miRNA表达谱比较、关键miRNA筛选及功能验证。源站未提供数据下载方式、文件格式说明、分析流程或代码等具体操作指引。

【质量与限制】

源站未提供测序质量评估、数据过滤标准、重复性验证、批次效应控制等质量相关信息。该数据集基于细胞系体外实验，非转移性与骨转移性Lewis肺癌细胞来源外泌体的miRNA谱差异可能无法完全反映体内肿瘤异质性和微环境复杂性。源站未提供样本量信息，统计效力未知。源站未提供数据完整性、覆盖度及潜在污染控制等限制说明。

【引用与许可】

源站未提供引用格式、文献出处、DOI、数据使用许可或授权条款等信息。使用该数据集时，应遵循ncbi.nlm.nih.gov的相关数据使用政策和许可要求。源站未提供具体许可类型及引用规范。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJEB100993

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB100993

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在鉴定外泌体中富集的、促进溶骨性骨转移的miRNA。我们直接对从非转移性（NC-LLC）或骨转移性（BM-LLC）Lewis肺癌细胞培养上清液中纯化的外泌体进行了miRNA测序。目的是分析这些肿瘤来源外泌体的miRNA货物，并鉴定细胞间通讯的关键调控因子。结合受体巨噬细胞的mRNA测序数据进行整合分析，发现外泌体miR-484是破骨细胞分化和骨转移的关键驱动因子。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别