小鼠RAW264.7巨噬细胞经骨转移性肺癌外泌体处理的RNA-seq研究破骨细胞分化
本数据集为小鼠RAW264.7巨噬细胞(破骨细胞前体)经非转移性(NC-LLC)或骨转移性(BM-LLC)Lewis肺癌细胞来源外泌体处理后的RNA-seq数据,用于研究外泌体诱导破骨细胞分化的差异表达基因与关键调控通路

基本信息
资源简介
小鼠RAW264.7巨噬细胞经骨转移性肺癌外泌体处理的RNA-seq研究破骨细胞分化
本数据集为小鼠RAW264.7巨噬细胞(破骨细胞前体)经非转移性(NC-LLC)或骨转移性(BM-LLC)Lewis肺癌细胞来源外泌体处理后的RNA-seq数据,用于研究外泌体诱导破骨细胞分化的差异表达基因与关键调控通路。结合外泌体small RNA测序数据,可识别miR-484-PECAM1轴作为该过程的关键驱动因素,并分析TRAP、CTSK、RANKL及NFATc1、c-Fos等破骨细胞生成标志物与转录因子的变化,适用于肿瘤骨转移机制与破骨细胞分化调控研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究旨在阐明骨转移性Lewis肺癌(BM-LLC)细胞来源外泌体促进溶骨性转移的机制。我们对经非转移性(NC-LLC)或骨转移性(BM-LLC)Lewis肺癌细胞来源外泌体处理的小鼠RAW264.7巨噬细胞(破骨细胞前体)进行了RNA-seq。目标是鉴定参与外泌体诱导破骨细胞分化的差异表达基因和关键调控通路。与外泌体small RNA测序数据的整合分析确定了miR-484-PECAM1轴是该过程的关键驱动因素。我们的发现揭示,BM-LLC外泌体将miR-484递送至受体巨噬细胞,抑制PECAM1表达,随后上调破骨细胞生成标志物(TRAP、CTSK、RANKL)和主要转录因子(NFATc1、c-Fos),从而重编程破骨细胞生成
【主题与分类】
主题标签:Other。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB100990
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- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在阐明骨转移性Lewis肺癌(BM-LLC)细胞来源的外泌体促进溶骨性转移的机制。我们对经非转移性(NC-LLC)或骨转移性(BM-LLC)Lewis肺癌细胞来源外泌体处理的小鼠RAW264.7巨噬细胞(破骨细胞前体)进行了RNA-seq,目的是鉴定参与外泌体诱导破骨细胞分化的差异表达基因和关键调控通路。结合外泌体小RNA测序数据的整合分析,确定了miR-484-PECAM1轴是这一过程的关键驱动因素。我们的研究结果揭示,BM-LLC外泌体将miR-484递送至受体巨噬细胞,抑制PECAM1表达,进而上调破骨细胞生成标志物(TRAP、CTSK、RANKL)和主转录因子(NFATc1、c-Fos),从而重编程破骨细胞生成并驱动骨破坏。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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