基本信息

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分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

肺癌患者BALF微生物组-代谢组失调数据集

PRJDB41385: Microbiome-Metabolome Dysbiosis of BALF in Lung Cancer（PRJCA048536）是一个聚焦于肺癌背景下支气管肺泡灌洗液（BALF）微生物组与代谢组失调的生物学项目数据集。该数据集归属于肿瘤/肺癌分类，主题标签为 Other，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。从整体定位看，它围绕肺癌患者气道微生态与代谢物变化这一核心方向，提供可用于微生物组与代谢组联合分析及相关生物标志物研究的数据资源。其源站标题显示为 human tracheal metagenome（ID 1460651）— BioProject — NCBI，表明该数据与人类气管宏基因组相关，并以 BioProject 形式组织。整体而言，该数据集适合关注肺癌微环境、气道微生物组和代谢组交互作用的研究者使用，为其提供可探索的数据入口。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI 的 BioProject 体系。BioProject 是围绕单一研究计划或由单一组织、联盟发起的一组生物学数据的集合，旨在为用户提供一个统一入口，以便找到该项目所产生的多种数据类型。该数据集的英文名称为 PRJDB41385: Microbiome-Metabolome Dysbiosis of BALF in Lung Cancer（PRJCA048536），源站标题为 human tracheal metagenome（ID 1460651）— BioProject — NCBI。其研究背景聚焦于肺癌，具体关注支气管肺泡灌洗液（BALF）中微生物组与代谢组的失调现象。本站分类为肿瘤 / 肺癌，主题标签为 Other。这些信息共同表明，该数据集属于肿瘤学与微生物组、代谢组交叉领域的研究资源。

【数据内容】

该数据集的核心内容围绕肺癌背景下 BALF 的微生物组与代谢组失调展开。根据侧写线索，其短描述指出数据聚焦于肺癌背景下支气管肺泡灌洗液的微生物组与代谢组失调，可用于探索肺癌患者气道微生态与代谢物变化，支持微生物组与代谢组联合分析及相关生物标志物研究。源站标题中提及 human tracheal metagenome，说明数据与人类气管宏基因组相关。除此之外，关于样本数量、具体微生物种类、代谢物名称、检测平台、数据文件格式等详细内容，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 的 BioProject 记录。源站描述说明，BioProject 记录提供用户一个单一位置，以查找为该项目生成的多种数据类型的链接。该数据集的源站标题为 human tracheal metagenome（ID 1460651）— BioProject — NCBI，英文名称为 PRJDB41385: Microbiome-Metabolome Dysbiosis of BALF in Lung Cancer（PRJCA048536）。关于具体采集地点、采集时间、受试者纳入标准、样本处理流程、测序或代谢组检测方法等采集细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于探索肺癌患者气道微生态与代谢物变化，支持微生物组与代谢组联合分析及相关生物标志物研究。其分类为肿瘤 / 肺癌，主题标签为 Other，因此可服务于肺癌相关的基础研究、微生态研究以及多组学整合分析等场景。研究者可利用该数据集寻找与肺癌相关的微生物组和代谢组特征，或将其作为联合分析的起点。关于具体的分析流程、推荐工具、统计方法或验证方案，源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 BioProject 形式组织，用户可通过 NCBI 的 BioProject 记录查找为该项目生成的多种数据类型的链接。源站描述指出，BioProject 记录提供用户一个单一位置来找到这些链接。因此，使用该数据集时，建议先访问其 BioProject 页面，再根据页面提供的链接获取相应的数据文件或相关信息。关于数据下载方式、文件格式、预处理步骤、分析软件或代码等具体使用方法，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公共生物学数据资源。其源站描述仅说明 BioProject 是相关生物学数据的集合，并提供查找多种数据类型的链接，但未提供关于数据质量、完整性、准确性、批次效应、样本量、覆盖度或潜在偏倚的具体信息。此外，关于该数据集的具体限制、使用注意事项或技术验证情况，源站未提供。使用者应结合自身研究目的，谨慎评估数据适用性。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 的 BioProject 记录。关于该数据集的具体引用方式、文献出处、许可协议、使用条款或数据共享政策，源站未提供。使用者如需引用或使用该数据集，应参考 NCBI BioProject 页面上的相关说明，并遵循 NCBI 的通用使用政策。由于源站未提供明确的许可信息，建议在使用前自行确认相关条款。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB41385

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJDB41385

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

2022年10月至2023年10月在天津市肿瘤医院和天津市胸科医院接受支气管镜检查的患者被纳入筛选。收集了95份支气管肺泡灌洗液（BALF）进行宏基因组测序和非靶向代谢组学分析。对肺癌组与良性肺部疾病组之间的微生物多样性、分类组成和代谢物谱进行了比较。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别