18只肺癌小鼠转录组数据(PRJDB39319)
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,收录 18 只小鼠 LLC 皮下肿瘤的转录组数据,属于肿瘤/肺癌方向。数据可用于研究肺癌小鼠模型的基因表达特征,支持差异表达分析、转录组水平比较等探索性分析,为肺癌相关机制研究提供转录组层面的数据基础(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

基本信息
资源简介
18只肺癌小鼠转录组数据(PRJDB39319)
该数据集英文名为 PRJDB39319: Transcriptomic data of 18 lung cancer mice (PRJCA044418),来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,本站分类归入肿瘤 / 肺癌方向。源站将其描述为 18 只小鼠 LLC 皮下肿瘤的转录组数据,主题标签为 Other。整体来看,这是一份围绕肺癌小鼠模型建立的转录组数据资源,样本对象为 LLC 皮下肿瘤,样本规模为 18 只小鼠。数据可用于研究肺癌小鼠模型的基因表达特征,支持差异表达分析、转录组水平比较等探索性分析,为肺癌相关机制研究提供转录组层面的数据基础。以下依据可获得的信息,对该数据集的相关方面作进一步说明。
【数据集背景】
该数据集属于肿瘤 / 肺癌方向,聚焦于肺癌小鼠模型的转录组层面。源站描述明确指出其内容为 18 只小鼠 LLC 皮下肿瘤的转录组数据,说明其研究对象是携带 LLC 皮下肿瘤的小鼠模型。此类数据通常服务于对肿瘤在转录组水平上的特征刻画,为后续的基因表达研究与机制探索提供数据基础。数据集的英文名称中同时包含 PRJDB39319 与 PRJCA044418 两个编号标识,可用于在相关数据体系中定位该数据集。
【数据内容】
数据内容为 18 只小鼠 LLC 皮下肿瘤的转录组数据。样本对象为小鼠 LLC 皮下肿瘤,样本数量为 18 只小鼠。数据主题标签为 Other。除上述信息外,源站未提供关于测序平台、读长、表达定量矩阵、样本分组、临床或表型注释等更细粒度的内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站对其的描述为 18 只小鼠 LLC 皮下肿瘤的转录组数据。关于样本采集的具体流程、测序建库方法、实验操作细节以及数据处理流程,源站未提供。
【适用场景】
依据其内容定位,该数据集可用于研究肺癌小鼠模型的基因表达特征,支持差异表达分析、转录组水平比较等探索性分析,为肺癌相关机制研究提供转录组层面的数据基础。其适用方向集中在肿瘤 / 肺癌相关的转录组研究场景。关于其他具体应用场景,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件组织格式、分析流程与参数设置等。使用者可依据来源站 ncbi.nlm.nih.gov 的一般数据获取途径自行查阅,但该数据集自身的具体使用说明源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的样本规模为 18 只小鼠,对象为 LLC 皮下肿瘤,属于小鼠模型层面的转录组数据。关于数据质量评估指标、批次信息、数据完整性说明以及使用中的注意事项,源站未提供。由于缺乏更详细的样本注释与实验描述,在开展差异表达分析或转录组水平比较时,需注意其模型来源与样本构成的限定范围。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者在引用或再利用该数据前,应自行向来源站 ncbi.nlm.nih.gov 核实相关的引用要求与使用条款。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJDB39319
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Transcriptomic data of 18 mice LLC subcutaneous tumors
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