PRJDB39147：菌株级遗传异质性与定植动态驱动微生物组治疗疗效（PRJCA044560）
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov，包含接受粪菌移植（FMT）联合免疫治疗的非小细胞肺癌患者纵向队列。供体提供 37 份粪便样本，受体在 FMT 前后共采集 66 份样本，前瞻性随访最长 11 个月，并开展宏基因组测序
基本信息
资源简介
PRJDB39147：菌株级遗传异质性与定植动态驱动微生物组治疗疗效（PRJCA044560）
PRJDB39147（PRJCA044560）是一项聚焦非小细胞肺癌患者肠道微生物组与治疗应答关系的纵向研究数据集，主题为“菌株水平遗传异质性与定植动态驱动微生物组治疗疗效”。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，在本站归类于肿瘤/肺癌方向。研究建立了接受粪菌移植（FMT）联合免疫治疗的非小细胞肺癌患者纵向队列，对供体与受体进行前瞻性随访，最长随访时间达11个月，并采集粪便样本开展宏基因组测序，用以刻画肠道微生物组的组成动态，并将微生物特征与临床结局相关联。数据集包含供体粪便样本37份，以及受体在FMT前后采集的样本共66份，为探索微生物组干预与肿瘤免疫治疗协同作用提供了纵向、多时间点的测序资源。
【数据集背景】
该数据集围绕非小细胞肺癌患者接受粪菌移植联合免疫治疗的临床场景建立。研究目的在于通过纵向队列设计，观察FMT干预前后肠道微生物组的组成变化，并进一步分析微生物特征与临床结局之间的关联。其核心科学关注点是菌株水平的遗传异质性与微生物定植动态如何影响微生物组治疗的整体疗效。数据集主题标签为“Other”，本站分类为肿瘤/肺癌，来源站为ncbi.nlm.nih.gov。
【数据内容】
数据内容主要包括来自供体和受体的粪便样本及其宏基因组测序信息。供体共提供37份粪便样本；受体在FMT前后共采集66份样本。测序策略为宏基因组测序，用于描绘肠道微生物组的组成动态，并支持将微生物特征与临床结局进行关联分析。样本采集覆盖FMT前与FMT后多个时间点，配合最长11个月的前瞻性随访，形成纵向数据框架。关于测序平台、读长、数据量、文件格式及具体临床变量字段等信息，源站未提供。
【采集与来源】
样本来源于接受FMT联合免疫治疗的非小细胞肺癌患者纵向队列。供体粪便样本37份，受体样本66份，分别在FMT前和FMT后采集。所有参与者接受前瞻性随访，随访时间最长可达11个月。数据来源站为ncbi.nlm.nih.gov，数据集英文名称为“PRJDB39147: Strain-Level Genetic Heterogeneity and Colonization Dynamics Drive Microbiome Therapeutic Efficacy (PRJCA044560)”。关于样本采集的具体操作规程、保存条件、伦理审批信息及测序服务提供方等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究肠道微生物组与肿瘤免疫治疗相互关系的研究者使用，尤其适合关注粪菌移植联合免疫治疗在非小细胞肺癌中应用的研究方向。可用于分析FMT前后肠道微生物组组成的时间动态、供体微生物在受体中的定植特征，以及微生物组特征与临床结局之间的关联。也可作为菌株水平遗传异质性相关方法学研究的纵向测序数据资源。关于该数据集是否适用于其他癌种或其他干预模式，源站未提供。
【使用方法】
使用时应依据样本的供体/受体身份以及FMT前、FMT后采集时间点进行分组，结合纵向随访时间框架开展组成动态与关联分析。宏基因组测序数据可用于微生物组成刻画和微生物特征提取，并与临床结局进行关联。关于数据下载方式、访问权限、文件组织结构和分析流程建议等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为纵向队列设计，供体样本37份、受体样本66份，随访最长11个月，样本量与随访时长构成其基本规模特征。关于测序深度、数据完整性、缺失值情况、批次效应及质量控制指标等，源站未提供。使用者在解释微生物特征与临床结局关联时，需注意该数据集的具体统计效力与混杂控制信息尚不明确。
【引用与许可】
数据集英文名称为“PRJDB39147: Strain-Level Genetic Heterogeneity and Colonization Dynamics Drive Microbiome Therapeutic Efficacy (PRJCA044560)”，来源站为ncbi.nlm.nih.gov。关于引用格式、许可条款和使用限制等，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJDB39147
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们建立了一个接受粪菌移植（FMT）联合免疫治疗的非小细胞肺癌患者纵向队列。对供体（37份粪便样本）和受体（FMT前后共采集66份样本）进行了长达11个月的前瞻性随访。通过宏基因组测序描绘肠道微生物组的组成动态，并将微生物特征与临床结局相关联。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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