PRJDB39132:癌症患者16s数据(PRJCA044420)

数据聚焦肿瘤领域的肺癌方向,可用于肺部肿瘤相关微生物组研究,支持对肺癌患者16s测序数据的分析与探索(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

sra
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基因组分类Other
PRJDB39132: 16s data of cancer patients (PRJCA044420)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJDB39132:癌症患者16s数据(PRJCA044420)

PRJDB39132(PRJCA044420)是一个聚焦肿瘤领域肺癌方向的16S测序数据集,来源于ncbi.nlm.nih.gov。根据源站描述,该数据集包含130名肺癌患者的16S数据,可用于肺部肿瘤相关微生物组研究,支持对肺癌患者16S测序数据的分析与探索。数据集以“Other”作为主题标签,整体定位在肿瘤/肺癌分类之下,为研究者了解肺癌患者微生物群落构成提供了数据基础。以下从数据集背景、数据内容、采集与来源、适用场景、使用方法、质量与限制、引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集归属于肿瘤研究中的肺癌方向。肺癌是肿瘤领域的重点研究对象之一,围绕肺癌患者开展微生物组层面的观察,有助于从微生物群落角度积累与肺部肿瘤相关的数据资料。数据集以16S数据为核心内容,面向肺癌患者群体,其背景定位与源站所标注的肿瘤/肺癌分类一致。源站对该数据集的描述为“16s data of 130 lung cancer patients”,表明其采集对象为肺癌患者,数据类型为16S测序数据。该数据集的主题标签为“Other”,未归入更细的主题类别。

【数据内容】

数据集的核心内容是130名肺癌患者的16S数据。16S数据通常指基于16S核糖体RNA基因的测序数据,用于刻画样本中的微生物群落组成,这一通用用途可用于理解该数据集的内容性质。就本数据集而言,其数据覆盖130名肺癌患者,具体样本类型、测序区域、序列数量、文件格式与数据规模等信息,源站未提供。数据集英文名中同时出现PRJDB39132与PRJCA044420两个编号,二者在数据集中的具体关系,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于ncbi.nlm.nih.gov。源站描述明确指出其为130名肺癌患者的16S数据,说明数据采集对象为肺癌患者。关于采集地点、采集时间、采集机构、伦理审批信息以及具体的样本采集流程,源站未提供。数据在源站的登记与组织方式,除数据集名称与来源站信息外,源站未提供更多细节。

【适用场景】

根据其主题定位,该数据集可用于肺部肿瘤相关微生物组研究,支持对肺癌患者16S测序数据的分析与探索。典型的使用方向包括对肺癌患者微生物群落组成的观察性分析,以及与其他微生物组数据集的比较研究等通用场景。需要说明的是,具体的研究设计适配性、可支持的统计分析方法与结论外推范围,需结合数据实际情况判断,源站未提供相关说明。

【使用方法】

该数据集可通过ncbi.nlm.nih.gov获取,具体访问路径、下载方式与数据组织格式,源站未提供。使用时应遵循16S数据分析的一般流程,包括序列质量控制、聚类或降噪、物种注释与群落多样性分析等通用步骤。关于该数据集是否附带分析脚本、元数据表或处理说明,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估信息,包括测序深度、序列质量、污染控制与批次效应等方面的说明。数据集仅覆盖130名肺癌患者,样本量与人群代表性方面的局限需使用者自行评估。此外,数据集缺少健康对照或其他对照组的说明,源站未提供相关信息。使用者在开展分析时应充分考虑上述不确定性。

【引用与许可】

该数据集在ncbi.nlm.nih.gov登记,具体引用方式、发表文献与许可条款,源站未提供。使用者在引用与再分发数据前,应查阅源站的相关规定并遵循数据使用要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJDB39132

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

16s data of 130 lung cancer patients

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