PRJDB36413：单细胞RNA测序解析共移植肿瘤中癌症相关成纤维细胞与非小细胞肺癌的贡献（PRJCA035563）
该数据集来自ncbi.nlm.nih.gov，属于肿瘤/肺癌分类，主题标签为Other。源站描述显示，为验证放射抵抗性NSCLC细胞对成纤维细胞的激活作用，研究者通过流式细胞术从皮下肿瘤（LLC+3T3、LLC+3T3+RT、LLCR+3T3、LLCR+3T3+RT）中分离GFP+成纤维细胞，并使用
基本信息
资源简介
PRJDB36413：单细胞RNA测序解析共移植肿瘤中癌症相关成纤维细胞与非小细胞肺癌的贡献（PRJCA035563）
该数据集英文名为 PRJDB36413: Single-cell RNA sequencing elucidates the co-transplanted tumor data, which includes contributions from both cancer-associated fibroblasts and non-small cell lung cancer (NSCLC) (PRJCA035563)，来源于 ncbi.nlm.nih.gov，在本站归入肿瘤 / 肺癌分类，主题标签为 Other。源站描述表明，该研究的目的是验证放射抵抗性非小细胞肺癌（NSCLC）细胞对成纤维细胞的激活作用。研究者从皮下肿瘤（LLC+3T3、LLC+3T3+RT、LLCR+3T3、LLCR+3T3+RT）中通过流式细胞术分离 GFP+ 成纤维细胞，随后使用 10x Chromium 平台对这些 GFP+ 成纤维细胞进行单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）分析。该数据集围绕共移植肿瘤中癌症相关成纤维细胞与非小细胞肺癌细胞的相互作用展开，为相关研究提供单细胞转录组层面的数据资源。
【数据集背景】
该数据集聚焦于肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞与非小细胞肺癌细胞之间的相互作用。源站描述指出，研究的核心目的是验证放射抵抗性 NSCLC 细胞能否激活成纤维细胞。为此，研究设计了包含 LLC 与 3T3 细胞的共移植皮下肿瘤模型，并设置了是否接受放射处理（RT）以及是否使用放射抵抗性 LLC 细胞（LLCR）的对照组合，即 LLC+3T3、LLC+3T3+RT、LLCR+3T3、LLCR+3T3+RT 四组。通过比较这些条件下成纤维细胞的状态，研究者希望从单细胞层面观察成纤维细胞被激活的情况。该数据集属于肿瘤 / 肺癌分类，主题标签为 Other。
【数据内容】
源站描述显示，该数据集的核心内容是针对 GFP+ 成纤维细胞的单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）数据。成纤维细胞来源于上述四组皮下肿瘤，经流式细胞术分选获得 GFP+ 细胞后，使用 10x Chromium 平台进行单细胞转录组测序。因此，数据内容围绕共移植肿瘤中成纤维细胞的单细胞转录组特征展开，并涵盖不同放射处理与不同 LLC 细胞类型组合下的样本。关于测序数据的具体规模、细胞数量、基因表达矩阵形式、文件格式与数据组织方式，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。样本采集方面，研究者从皮下肿瘤（LLC+3T3、LLC+3T3+RT、LLCR+3T3、LLCR+3T3+RT）中分离 GFP+ 成纤维细胞，分离手段为流式细胞术。测序平台为 10x Chromium。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、动物实验细节以及测序试剂与版本等，源站未提供。
【适用场景】
基于源站描述，该数据集适用于研究放射抵抗性非小细胞肺癌细胞对成纤维细胞的激活作用，以及共移植肿瘤模型中癌症相关成纤维细胞的异质性。其单细胞分辨率可用于比较不同放射处理条件和不同 LLC 细胞类型组合下成纤维细胞的转录组差异。此外，该数据集也可为肿瘤微环境中成纤维细胞与肺癌细胞相互作用的相关分析提供数据基础。关于其他具体应用场景，源站未提供。
【使用方法】
源站描述仅说明数据通过 10x Chromium 平台对 GFP+ 成纤维细胞进行 scRNA-seq 获得，未提供具体的数据处理流程、质控标准、分析软件、降维聚类方法或代码。关于如何下载、解压、读取和使用该数据集的具体步骤，源站未提供。
【质量与限制】
源站描述未提供该数据集的质控指标、测序深度、细胞存活率、批次效应评估或数据完整性说明。该数据集基于小鼠来源的 LLC 与 3T3 共移植肿瘤模型，其结论向人类非小细胞肺癌的推广需谨慎。关于样本量、重复数以及潜在技术偏差等信息，源站未提供。
【引用与许可】
源站描述未提供该数据集的引用方式、文献出处、DOI、许可协议或使用限制。相关内容源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJDB36413
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为验证放射抵抗性NSCLC细胞对成纤维细胞的激活作用，我们利用流式细胞术从皮下肿瘤（LLC+3T3、LLC+3T3+RT、LLCR+3T3、LLCR+3T3+RT）中分离出GFP+成纤维细胞。随后，使用10x Chromium平台对GFP+成纤维细胞进行了单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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