PRJDB36286：S100a4+肺泡巨噬细胞通过促进脂肪酸代谢加速癌前非典型腺瘤样增生进展（PRJCA028360）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJDB36286

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肺癌发生之前存在癌前病变，而驱动这一转变的因素以及在肿瘤起始背景下的潜在调控模式仍有待阐明。在癌前病变过程中，我们发现了代谢模式的阶段性转变。巨噬细胞是肿瘤微环境中具有高度可塑性的异质性细胞群体。单细胞相互作用和代谢分析揭示了一种细胞状态，即S100a4+肺泡巨噬细胞，该细胞在非典型腺瘤样增生阶段表现出独特的脂肪酸代谢活性，如棕榈酸代谢，并伴随在肿瘤形成前环境中的促血管生成功能。这些发现在人类单细胞转录组中可重现，并已通过组织病理学染色和体外细胞共培养实验得到证实。综上所述，本研究结果表明，特定的肺泡巨噬细胞亚群通过改变其代谢状态促进肿瘤发生，提示在疾病早期针对该细胞状态进行代谢干预可能延缓肺上皮的肿瘤性转化。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。