PRJDB15361:基于生物工程大鼠肺的肺癌模型

本研究描述了一种基于生物工程肺成功构建的离体肺癌模型。具体而言,我们展示了大鼠肺的脱细胞处理,随后用多种非癌细胞类型和人肺癌细胞系进行再细胞化,从而得到一个在形态和生理上与体内肺癌相似的 3-D 模型

ena
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基因组分类肺癌生物工程肺脱细胞再细胞化3-D模型A549RNA-seq
PRJDB15361: Lung cancer model using bioengineered rat lungs

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-06

资源简介

PRJDB15361:基于生物工程大鼠肺的肺癌模型

本研究描述了一种基于生物工程肺成功构建的离体肺癌模型。具体而言,研究展示了大鼠肺的脱细胞处理,随后用多种非癌细胞类型和人肺癌细胞系进行再细胞化,从而得到一个在形态和生理上与体内肺癌相似的 3-D 模型。该数据集英文名称为 PRJDB15361: Lung cancer model using bioengineered rat lungs,在分类上属于肿瘤 / 肺癌方向,来源站为 ebi.ac.uk。研究中使用 A549 细胞进行 RNA-seq 分析,为肺癌的体外建模与转录组研究提供了基于生物工程肺的实验体系。

【数据集背景】

肺癌是肿瘤研究中的重要领域,建立能够较好模拟体内肺癌形态与生理特征的模型,对于理解肺癌生物学行为和研究干预手段具有重要意义。传统二维细胞培养难以充分再现体内肿瘤的三维结构和生理环境,因此需要发展更接近体内状态的模型体系。该数据集所对应的研究正是围绕这一需求展开,尝试利用生物工程肺构建离体肺癌模型。研究以大鼠肺为起点,通过脱细胞处理去除原有细胞成分,再以多种非癌细胞类型和人肺癌细胞系进行再细胞化,从而形成三维模型。该模型在形态和生理上与体内肺癌相似,为肺癌研究提供了一种离体实验平台。该数据集收录于 ebi.ac.uk,归类于肿瘤 / 肺癌方向,英文名称为 PRJDB15361: Lung cancer model using bioengineered rat lungs。

【数据内容】

该数据集的核心内容与基于生物工程大鼠肺的离体肺癌模型相关。研究过程中,大鼠肺经过脱细胞处理,随后被多种非癌细胞类型以及人肺癌细胞系再细胞化,最终形成三维模型。该模型在形态和生理上与体内肺癌相似。研究中使用了 A549 细胞进行 RNA-seq 分析,因此数据集包含与 RNA-seq 分析相关的数据内容。关于数据的具体规模、文件类型、样本数量、测序深度、数据大小等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk。研究以大鼠肺为材料,先进行脱细胞处理,再使用多种非癌细胞类型和人肺癌细胞系进行再细胞化,构建离体肺癌模型。用于 RNA-seq 分析的细胞为 A549 细胞。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、实验操作细节等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与肺癌体外模型相关的研究场景,尤其是基于生物工程肺的三维肺癌模型研究。由于研究使用 A549 细胞进行 RNA-seq 分析,该数据集可用于涉及肺癌细胞转录组分析的研究方向。该模型在形态和生理上与体内肺癌相似,因此也可能适用于需要更接近体内状态的三维肺癌模型的研究。关于该数据集在其他具体应用场景中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

该数据集英文名称为 PRJDB15361: Lung cancer model using bioengineered rat lungs,来源站为 ebi.ac.uk。关于数据的具体下载方式、访问链接、数据处理流程、分析工具、参数设置等使用方法,源站未提供。

【质量与限制】

该研究构建的模型在形态和生理上与体内肺癌相似,并使用 A549 细胞进行了 RNA-seq 分析。关于数据的质量评估指标、批次效应、覆盖度、重复性、局限性等具体信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk,英文名称为 PRJDB15361: Lung cancer model using bioengineered rat lungs。关于引用方式、许可协议、使用限制等具体信息,源站未提供。

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源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB15361

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究描述了一种基于生物工程肺的成功离体肺癌模型的建立。具体而言,我们证明,将大鼠肺去细胞化,随后用多种非癌细胞类型和人肺癌细胞系进行再细胞化,可得到一个在形态学和生理学上与体内肺癌相似的三维模型。我们使用A549细胞进行RNA-seq分析。

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