亚洲不吸烟女性肺癌易感性GWAS

该数据集为dbGaP研究,英文名phs000716,主题为亚洲不吸烟女性肺癌易感性GWAS,采用病例对照与队列设计。数据覆盖亚洲不吸烟女性人群,聚焦肺癌易感性的遗传关联分析

dbgap
浏览 5
基因组分类Case-Control, Cohort
phs000716: GWAS of Lung Cancer Susceptibility in Never-Smoking Women in Asia

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

亚洲不吸烟女性肺癌易感性GWAS

phs000716 是一项聚焦亚洲不吸烟女性肺癌易感性的全基因组关联研究(GWAS),来源于 NCBI 的 dbGaP 数据库。该研究采用病例对照与队列相结合的设计,旨在从遗传学角度探索不吸烟女性群体中肺癌易感性的关联因素。数据集以亚洲不吸烟女性人群为研究对象,围绕肺癌易感性的遗传关联分析展开,属于肿瘤领域中肺癌方向的研究资源。其核心价值在于为不吸烟女性这一特殊群体的肺癌遗传机制研究提供数据支撑,有助于推动该人群肺癌风险相关遗传变异的识别与验证。

【数据集背景】

肺癌通常与吸烟行为高度相关,但在亚洲女性群体中,相当比例的肺癌患者并无吸烟史,这提示遗传因素可能在不吸烟女性肺癌发生中扮演重要角色。phs000716 正是针对这一科学问题而设立的研究项目,其英文全称为“GWAS of Lung Cancer Susceptibility in Never-Smoking Women in Asia”。该研究以亚洲不吸烟女性为对象,试图通过全基因组关联分析手段,揭示与肺癌易感性相关的遗传变异。研究采用病例对照与队列设计,兼顾了病例与对照的比较以及队列随访观察的优势,为探索遗传易感性提供了较为严谨的研究框架。

【数据内容】

该数据集的主题标签为病例对照与队列,表明其数据组织方式涵盖这两种流行病学研究设计。研究内容聚焦于亚洲不吸烟女性肺癌易感性的全基因组关联分析,数据覆盖亚洲不吸烟女性人群。关于具体的样本量、遗传标记数量、表型字段、随访时长等详细数据内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 数据库,属于 dbGaP 研究项目。dbGaP 即基因型与表型数据库,是美国国家生物技术信息中心提供的用于存储和分发基因型与表型关联研究数据的平台。源站描述将其标注为“dbGaP study (Case-Control, Cohort)”,说明该研究在 dbGaP 中被归类为病例对照与队列研究。关于具体的采集地点、采集时间、招募方式、样本处理流程等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肺癌遗传易感性的研究,尤其是针对亚洲不吸烟女性人群的遗传关联分析。潜在应用场景包括:识别与不吸烟女性肺癌风险相关的遗传变异、验证已知肺癌易感位点在该人群中的效应、开展跨人群遗传比较研究、以及为肺癌风险预测模型提供遗传学证据。此外,由于研究同时采用病例对照与队列设计,也可用于探索遗传因素与环境因素在肺癌发生中的交互作用。关于该数据集是否已被用于特定研究或是否支持特定分析流程,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 dbGaP 平台发布,通常需要遵循 dbGaP 的数据访问流程进行申请与获取。关于具体的下载方式、数据格式、分析工具要求、访问权限层级等信息,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 dbGaP,属于受控访问的研究资源,其数据质量通常受到 dbGaP 平台的管理与审核。研究设计采用病例对照与队列相结合的方式,有助于提升结果的可靠性。然而,关于样本量、统计功效、人群代表性、是否存在批次效应、基因分型平台、质量控制标准等具体质量指标,源站未提供。此外,该数据集聚焦于亚洲不吸烟女性,其结论外推至其他人群或其他肺癌亚型时需谨慎。关于具体的限制说明,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 数据库,使用时应遵循 dbGaP 的引用规范与数据使用协议。关于具体的引用格式、许可条款、数据使用限制、知识产权归属等信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000716

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case-Control, Cohort).

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