NHLBI GO-ESP 心脏队列外显子组测序项目(ARIC)

源站将其描述为病例对照与队列研究,主题标签包括 Case-Control 和 Cohort。数据围绕 NHLBI GO-ESP 项目下的心脏队列外显子组测序展开,涉及 ARIC 队列

dbgap
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基因组分类Case-Control, Cohort
phs000398: NHLBI GO-ESP: Heart Cohorts Exome Sequencing Project (ARIC)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

NHLBI GO-ESP 心脏队列外显子组测序项目(ARIC)

phs000398 是 NCBI dbGaP 平台收录的一项研究数据集,英文全称为 NHLBI GO-ESP: Heart Cohorts Exome Sequencing Project (ARIC)。该数据集在分类上归属于循环系统疾病下的其他类别,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站将其描述为一项病例对照与队列研究,主题标签包括 Case-Control 和 Cohort。数据内容围绕美国国家心肺血液研究所(NHLBI)GO-ESP 项目下的心脏队列外显子组测序展开,涉及 ARIC 队列。整体而言,该数据集以外显子组测序为核心手段,结合病例对照与队列研究设计,服务于心血管相关性状的遗传学研究。

【数据集背景】

该数据集隶属于 NHLBI GO-ESP 项目,全称为 Heart Cohorts Exome Sequencing Project,即心脏队列外显子组测序项目。项目聚焦于心脏相关队列,采用外显子组测序技术路线。数据集所涉及的 ARIC 队列是该项目下的组成部分之一。源站将其研究类型标注为病例对照与队列研究,说明其设计同时具备两种流行病学研究特征。数据集收录于 NCBI 的 dbGaP 平台,该平台是存储基因型与表型关联研究数据的公开数据库。本站将其归类于循环系统疾病下的其他类别,反映其与心血管系统疾病的关联定位。

【数据内容】

数据内容围绕心脏队列的外显子组测序展开,涉及 ARIC 队列。外显子组测序针对基因组中的蛋白编码区域,可用于识别与疾病或性状相关的编码区变异。源站描述中标注的研究类型为病例对照与队列,主题标签同样包括 Case-Control 与 Cohort,表明数据在样本组织上兼具病例与对照的对比设计以及队列随访的结构特征。关于具体的样本量、测序深度、变异位点数量、表型字段种类等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,具体收录于 dbGaP 研究数据库。数据集英文名中的 phs000398 为 dbGaP 的研究登录号。数据采集自 NHLBI GO-ESP 项目下的心脏队列,涉及 ARIC 队列。关于样本采集的具体时间、地点、机构、伦理审批信息以及测序平台与流程等,源站未提供。

【适用场景】

基于源站标注的病例对照与队列研究类型以及外显子组测序内容,该数据集可适用于心血管相关性状或疾病的遗传关联研究、编码区变异的发现与验证,以及结合队列随访信息与病例对照设计的遗传流行病学分析。主题标签中的 Case-Control 与 Cohort 提示其可用于比较病例与对照之间的变异频率差异,也可用于队列框架下的风险关联评估。关于具体可分析的表型范围或已发表的研究方向,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 NCBI dbGaP 平台提供,研究登录号为 phs000398。使用者通常需遵循 dbGaP 的数据访问流程获取数据。关于具体的下载方式、文件格式、数据处理步骤、分析工具建议等,源站未提供。

【质量与限制】

源站将该数据集描述为病例对照与队列研究,并标注了相应主题标签。关于数据质量指标、缺失率、批次效应、人群代表性、样本排除标准等具体质量信息,源站未提供。使用者在解释结果时需注意研究设计本身的固有局限,例如病例对照设计可能受选择偏倚影响,队列设计可能受随访时间与失访影响,但该数据集在这些方面的具体情况源站未提供。

【引用与许可】

该数据集收录于 NCBI dbGaP,研究登录号为 phs000398。关于具体的引用格式、许可条款、数据使用协议、致谢要求等,源站未提供。使用者应参照 dbGaP 平台及数据提交方的相关规定进行引用与合规使用。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000398

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case-Control, Cohort).

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