减少癌症健康差异的患者来源异种移植模型

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04410302

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：膀胱癌、胃癌、肝及肝内胆管癌、肺癌、恶性肿瘤。主要目标：I. 开发并表征超过200例患者来源的异种移植模型（PDXs），其中胃癌、肝癌、膀胱癌和肺癌各至少50例PDXs，约60%的PDXs来自少数族裔患者，重点关注西班牙裔/拉丁裔美国人[HLAs]、非裔美国人[AAs]以及亚裔美国人/夏威夷原住民/太平洋岛民[AANHPIs]。II. 利用这些PDXs进行单药及联合用药的临床前测试，以指导精准癌症医学决策，重点针对居住在加利福尼亚州的主要种族/族裔少数群体，并与非西班牙裔白人[NHWs]进行比较。III. 作为研究项目1，开展“利用PDX模型表征胃和肝肿瘤的治疗反应”，重点关注主要来自HLAs和AANHPI患者的最常见组织学类型的胃癌（GC）和肝癌（LC）。IV.

开展“利用PDX模型表征肺和膀胱肿瘤的治疗反应”作为研究项目2，重点关注主要来自AA和NHW患者的肺鳞状细胞癌（LSCC）和晚期尿路上皮癌或膀胱癌（aBC）。V. 与国立癌症研究所（NCI）、其他PDX开发与试验中心（PDTC）、非PDXNet、PDXNet数据共享平台和协调中心合作，以完成PDXNet的使命。VI. 通过试点项目与跨网络活动核心（PPTNAC）选择并开展试点项目，包括UCaMP成员、其他PDTC及其他机构，这些项目将利用PDX模型评估比较治疗反应，并有助于阐明胃癌、肝癌、膀胱癌和肺癌中癌症健康差异的生物学决定因素。概要：患者在标准治疗肿瘤活检或手术切除期间接受肿瘤组织样本采集，以建立PDX。患者还可能接受血液、唾液和尿液样本采集，以将脱氧核糖核酸（DNA）异常与非癌细胞进行比较，从而确定

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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