Nuclear Factor I/B 是小细胞肺癌的致癌基因
该数据集来自 omicsdi.org，主题为肿瘤/肺癌，聚焦小细胞肺癌（SCLC）的分子与基因组特征。研究利用 Trp53 和 Rb1 条件性敲除的小鼠 SCLC 模型，发现多个高频、大幅度的局灶性 DNA 拷贝数改变，并鉴定出新型致癌转录因子 Nuclear Factor I/B（Nfib）在小鼠
基本信息
资源简介
Nuclear Factor I/B 是小细胞肺癌的致癌基因
该数据集来自 omicsdi.org，主题为肿瘤/肺癌，聚焦小细胞肺癌（SCLC）的分子与基因组特征。研究利用 Trp53 和 Rb1 条件性敲除的小鼠 SCLC 模型，发现多个高频、大幅度的局灶性 DNA 拷贝数改变，并鉴定出新型致癌转录因子 Nuclear Factor I/B（Nfib）在小鼠模型和人 SCLC 中扩增。功能研究显示 NFIB 在转化过程中调控细胞活力和增殖。数据包含基因表达分析内容，可用于探索 SCLC 的致癌机制与潜在分子靶点（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：小细胞肺癌（SCLC）是一种侵袭性癌症，通常在转移至远处部位后才被诊断出来（Meuwissen and Berns 2005; Cooper and Spiro 2006）。尽管有必要更好地理解这种疾病，但 SCLC 在分子和基因组水平上仍然特征不明（Forgacs et al. 2001; Pleasance et al. 2010）。利用一种由肺部条件性删除 Trp53 和 Rb1 驱动的 SCLC 基因工程小鼠模型（Jonkers et al. 2001; Vooijs et al. 2002; Meuwissen et al. 2003; Sage et al. 2003），我们在 SCLC 中鉴定出若干频繁、高幅度的局灶性 DNA 拷贝数改变。我们在小鼠 SCLC 模型和人 SCLC 中发现了一种新型致癌转录因子 Nuclear Factor I/B（Nfib）的扩增。功能研究表明，NFIB 在转化过程中调控细胞活力和增殖。对两个 re
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-29533
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- OpenDataLab:
数据说明
小细胞肺癌（SCLC）是一种侵袭性癌症，通常在转移至远处部位后才被诊断出来（Meuwissen and Berns 2005; Cooper and Spiro 2006）。尽管有必要更深入地了解这种疾病，但SCLC在分子和基因组层面的特征仍不明确（Forgacs et al. 2001; Pleasance et al. 2010）。利用在肺中条件性敲除Trp53和Rb1驱动的基因工程小鼠SCLC模型（Jonkers et al. 2001; Vooijs et al. 2002; Meuwissen et al. 2003; Sage et al. 2003），我们在SCLC中鉴定出若干频繁的、高幅度的局灶性DNA拷贝数改变。我们在小鼠SCLC模型和人类SCLC中发现了新型致癌转录因子核因子I/B（Nfib）的扩增。功能研究表明，NFIB在转化过程中调控细胞活力和增殖。对两个独立mSCLC细胞系（3583T3和3151T4）各两个重复样本进行的基因表达分析，这些细胞系稳定表达Nfib、Mycl1或同时表达Nfib和Mycl1
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
