肺癌患者及非癌肺病对照的miRNA表达谱
数据内容为肺癌患者与患有其他非癌肺病对照的血浆miRNA表达谱,其中患者血浆样本来自26位患者、最多8个时间点采集,对照样本来自12位对照

基本信息
资源简介
肺癌患者及非癌肺病对照的miRNA表达谱
该数据集名为 miRNA Profiles in lung cancer patients and controls with other non-cancer lung diseases,收录于 omicsdi.org,在本站归类为肿瘤 / 肺癌方向。其核心内容是肺癌患者与患有其他非癌肺病对照人群的血浆 miRNA 表达谱。根据源站描述,该项目分析的血浆样本来自 26 位患者,这些患者样本在最多 8 个时间点被采集;同时还包括 12 位对照的血浆样本。数据集的主题标签为 Transcriptomics,说明其数据主体属于转录组学范畴,围绕 miRNA 这一转录后调控层面的分子展开。整体来看,该数据集可用于比较肺癌患者与非癌肺病对照在血浆 miRNA 表达上的差异,并可能反映患者在不同时间点上的表达变化趋势,为肺癌相关分子标志物研究提供基础数据资源。
【数据集背景】
肺癌是全球范围内发病率和死亡率较高的恶性肿瘤之一,早期发现和疗效监测对改善患者预后具有重要意义。血浆中的 miRNA 作为一种相对稳定、可重复采集的分子标志物,在肿瘤液体活检研究中受到广泛关注。该数据集聚焦于肺癌患者与患有其他非癌肺病对照之间的血浆 miRNA 表达谱比较,其背景在于通过转录组学手段探索肺癌患者血浆 miRNA 的特征性变化,并借助非癌肺病对照来区分肺癌特异性信号与非特异性肺部疾病相关信号。源站描述指出,该项目分析的是肺癌患者和患有其他非癌肺病对照的血浆样本,主题标签为 Transcriptomics,表明其研究视角属于转录组学层面。
【数据内容】
数据内容为肺癌患者与患有其他非癌肺病对照的血浆 miRNA 表达谱。根据源站描述,患者血浆样本来自 26 位患者,这些样本在最多 8 个时间点被采集;对照样本来自 12 位对照。因此,数据集在样本结构上包含患者组与对照组两类来源,其中患者组具有纵向采集特征,即同一患者可能贡献多个时间点的血浆样本。数据主题标签为 Transcriptomics,说明其检测和分析对象为转录组相关分子,具体为 miRNA 表达谱。除上述信息外,源站未提供关于 miRNA 具体种类、检测平台、表达值形式、数据文件格式等更详细的内容。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述说明,该项目分析的是从 26 位患者采集的血浆样本,采集时间点最多为 8 个;同时分析了来自 12 位对照的血浆样本。患者为肺癌患者,对照为患有其他非癌肺病的人群。血浆是该数据集的样本类型。关于样本采集的具体地点、时间跨度、采集机构、伦理审批信息、患者年龄性别分布、对照的具体疾病构成等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肺癌相关血浆 miRNA 表达谱的比较研究,尤其适合关注肺癌患者与患有其他非癌肺病对照之间差异的分析场景。由于患者样本来自 26 位患者且最多覆盖 8 个时间点,该数据集也可用于探索同一患者在不同时间点上的 miRNA 表达变化,例如治疗前后或疾病进展过程中的纵向趋势分析。主题标签为 Transcriptomics,因此其适用领域包括转录组学数据分析、miRNA 标志物筛选、液体活检相关方法开发等。此外,该数据集可用于方法学验证或作为公共数据资源进行二次分析。但需注意,源站未提供具体的分析流程、统计方法或验证结果,因此适用场景应基于数据内容本身进行合理界定,而不应推断其已具备特定临床结论。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件组织格式、预处理步骤、归一化方法、差异表达分析流程、统计软件或代码等。使用者如需使用该数据集,应参考 omicsdi.org 上该数据集的原始页面或相关项目说明,以获取访问途径和技术细节。由于源站描述仅提及样本来源和分析对象,未说明数据是否公开、是否需要申请、是否附带元数据表或分析脚本,因此无法在本介绍中给出具体操作指引。
【质量与限制】
该数据集的样本规模为 26 位肺癌患者和 12 位对照,患者样本最多覆盖 8 个时间点。这一设计使其具备纵向比较的潜力,但对照数量相对有限,且对照为患有其他非癌肺病的人群,而非完全健康人群。因此,在解释肺癌特异性 miRNA 信号时,需考虑非癌肺病本身可能带来的表达影响。源站未提供关于测序深度、检测灵敏度、缺失值比例、批次效应、数据质控标准等信息,也未说明样本采集时间点之间的间隔、患者治疗状态或疾病分期。这些因素可能影响数据的使用和解释。此外,源站未提供任何已验证的结论或标志物列表,使用者不应将本数据集视为已确立临床效用的产品。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息。使用者如需引用或使用该数据集,应访问 omicsdi.org 上对应的数据集页面,查阅其原始来源所附的引用要求与许可声明。在未获得明确许可信息前,不应假设该数据集可自由用于商业或再分发目的。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-68951
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本项目分析肺癌患者及患有其他非癌性肺部疾病的对照者的血浆特征谱。对采集自26例患者(最多8个时间点)和12例对照者的血浆进行分析。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




