MiRNA 与肺癌(INCA 项目)- 26 张 RNG25k 微阵列
数据包含 26 张 RNG25k 微阵列,用于分析 13 对原发性肺癌及其对应非癌肺组织中的基因表达。样本取自法国 Nice Hospital Tumor Bio Bank,采用染料交换实验比较癌组织与邻近正常肺组织

基本信息
资源简介
MiRNA 与肺癌(INCA 项目)- 26 张 RNG25k 微阵列
MiRNA and lung cancer (INCA project) - 26 RNG25k microarrays 是一个面向肺癌转录组研究的微阵列数据集,收录于 omicsdi.org,在本站归类于肿瘤 / 肺癌方向。该数据集围绕原发性肺癌与其对应非癌肺组织之间的基因表达差异展开,共包含 26 张 RNG25k 微阵列,对应 13 对配对的肺癌及邻近正常肺组织样本。实验采用染料交换设计,对癌组织与邻近正常肺组织进行直接比较,样本来源于法国 Nice Hospital Tumor Bio Bank。数据集的主题标签为 Transcriptomics,整体定位于通过全转录组表达谱刻画肺癌发生过程中基因表达变化的基础研究资源。
【数据集背景】
肺癌是全球范围内发病率和死亡率均较高的恶性肿瘤之一,其发生发展涉及大量基因表达调控的改变。要理解肿瘤与正常组织之间的分子差异,需要在配对的临床样本上开展系统的转录组检测。该数据集正是基于这一研究需求而建立:通过比较同一患者的原发性肺癌组织与其对应的非癌肺组织,减少个体间遗传背景差异带来的干扰,从而更准确地识别与肺癌相关的表达改变。数据集名称中的 INCA project 表明其属于一个既定的研究项目框架,而 RNG25k 则指明了所使用的微阵列平台类型。
【数据内容】
该数据集的核心内容是 26 张 RNG25k 微阵列所承载的基因表达数据。这些微阵列对应 13 对样本,即每一对包含一份原发性肺癌组织和一份来自同一患者的对应非癌肺组织。实验设计为染料交换实验,即通过交换荧光染料标记的方式对癌组织与邻近正常肺组织进行比较,以降低染料偏好可能引入的系统偏差。数据集的主题标签为 Transcriptomics,说明其数据层次属于转录组水平,反映的是基因表达丰度信息,而非基因组序列或表观遗传修饰。除上述内容外,源站未提供关于具体基因数量、探针注释、表达值分布等更细粒度的信息。
【采集与来源】
样本采集自法国 Nice Hospital Tumor Bio Bank。该生物样本库为数据集提供了 13 对原发性肺癌及其对应的非癌肺组织标本。实验比较的对象是癌组织与相邻正常肺组织,属于典型的配对样本设计。数据来源站为 omicsdi.org,该平台对数据集进行了收录与描述。除样本来源机构、样本配对数量及实验比较方式外,源站未提供关于患者临床特征、肿瘤分期、组织学亚型、样本处理流程及伦理审批等详细信息。
【适用场景】
基于其配对设计和转录组表达谱特征,该数据集适用于肺癌与正常肺组织之间差异表达基因的识别研究,也可用于染料交换实验设计下的表达数据归一化与偏差评估方法探索。由于样本来自同一患者的癌与癌旁组织配对,该数据适合开展配对统计分析,以控制个体差异。此外,该数据集可作为肺癌转录组研究的验证或整合分析资源,用于与其他肺癌表达数据集进行比较。需要说明的是,以上适用方向基于数据集本身的配对比较设计和转录组属性,源站未提供针对特定分析流程或特定疾病亚型的适用性说明。
【使用方法】
该数据集以微阵列形式提供,包含 26 张 RNG25k 芯片,对应 13 对癌与正常肺组织样本。使用时应按照染料交换实验的特点处理数据,考虑不同荧光标记通道之间的校正问题。由于样本为配对设计,分析时宜采用配对比较策略。源站未提供关于数据预处理步骤、归一化方法、质量控制标准以及推荐分析软件的具体说明,使用者在实际分析前需自行评估数据格式与处理流程。
【质量与限制】
该数据集的一个显著优势在于采用了癌组织与邻近正常肺组织的配对设计,并使用了染料交换实验方案,有助于减少个体差异和染料偏差的影响。样本来源为医院肿瘤生物样本库,具备一定的临床样本基础。然而,数据集规模有限,仅包含 13 对样本、26 张微阵列,样本量较小可能限制统计功效和结论的泛化能力。此外,源站未提供关于样本临床信息、平台技术参数、数据质量控制指标以及潜在批次效应等方面的说明,这些因素可能影响数据解读的全面性。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、文献出处、DOI 标识以及使用许可条款等信息。使用者在引用或再利用该数据集前,应自行向数据来源站或样本提供机构确认相关的引用要求和许可条件。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-18694
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对13对原发性肺癌及其对应的非癌肺组织进行基因表达分析。这些标本取自法国尼斯医院肿瘤生物样本库。染料交换实验比较癌组织与邻近正常肺组织。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




